RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tarbp1E9Q368 1579 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1gQ61074 542 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.79■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif21bQ9QXL1 1668 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gas2l2Q5SSG4 860 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc30Q8BVF4 654 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp1b4Q99ME6 356 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa20.77■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.77■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Golga2Q921M4 999 aa20.77■□□□□ 0.92
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pank1Q8K4K6 548 aa20.75■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6268A2A3U9 297 aa20.75■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14025A2AP89 1413 aa20.75■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ak7Q9D2H2 614 aa20.72■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmn2Q9JL04 1578 aa20.72■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa20.72■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ak9G3UYQ4 1894 aa20.72■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stag3O70576 1240 aa20.71■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm5cP41230 1554 aa20.71■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atxn3Q9CVD2 355 aa20.71■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nkx1-2P42580 305 aa20.7■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdm16A2A935 1275 aa20.7■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa20.69■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk26Q99JT2 416 aa20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mre11Q61216 706 aa20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ipo8Q7TMY7 1010 aa20.67■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lemd3Q9WU40 921 aa20.66■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apaf1O88879 1249 aa20.65■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgd1P52734 960 aa20.65■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AI481877A2ALV5 1481 aa20.65■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zranb1Q7M760 708 aa20.64■□□□□ 0.9
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhh1Q80TI1 1356 aa20.63■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp10dQ8K2X1 1416 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cluap1Q8R3P7 413 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nsd2Q8BVE8 1365 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf608Q56A10 1511 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf692Q3U381 531 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts13Q769J6 1426 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rusc2Q80U22 1514 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ksr2Q3UVC0 959 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ErbinQ80TH2 1402 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc21bQ0HA38 1315 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf330Q922H9 316 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vsig10D3YX43 558 aa20.58■□□□□ 0.89
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex14Q7M6U3 1450 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pknox2Q8BG99 474 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Htatsf1Q8BGC0 757 aa20.55■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tulp4Q9JIL5 1547 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc183A2AJB1 534 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GsdmaQ9EST1 446 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plch2A2AP18 1501 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcc6Q9R1S7 1498 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AU015836B2RUM3 263 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tsen2Q6P7W5 460 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mink1Q9JM52 1308 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IqubQ8CDK3 788 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taok2Q6ZQ29 1240 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp19Q3UJD6 1360 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uspl1Q3ULM6 1089 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mast1Q9R1L5 1570 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plcb2A3KGF7 1181 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ralbp1Q62172 648 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rlbp1Q9Z275 317 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TnikP83510 1323 aa20.46■□□□□ 0.87
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbno1Q689Z5 1390 aa20.45■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P2rx7Q9Z1M0 595 aa20.45■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa20.45■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.7 ms