RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrs2Q5NCE8 434 aa17.22■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Supt16hQ920B9 1047 aa17.22■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqgap3F8VQ29 1632 aa17.21■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa17.21■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plch2A2AP18 1501 aa17.21■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa0556Q8C753 1610 aa17.21■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fan1Q69ZT1 1020 aa17.21■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20521D3Z5F7 333 aa17.2■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa17.2■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hecw2Q6I6G8 1578 aa17.2■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.2■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Synj2Q9D2G5 1434 aa17.19■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AatkQ80YE4 1365 aa17.18■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Qser1A2BIE1 1698 aa17.17■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uggt2E9Q4X2 1504 aa17.17■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rock2P70336 1388 aa17.17■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp1b4Q99ME6 356 aa17.15■□□□□ 0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srcin1Q9QWI6 1250 aa17.13■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc6Q8R313 802 aa17.12■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abca8aQ8K442 1620 aa17.12■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhg5Q66T02 1073 aa17.11■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa17.1■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Knl1Q66JQ7 1612 aa17.1■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo3aQ8K3H5 1613 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AU022751B1B0V2 589 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp40Q8BWR4 1235 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap12Q9WTQ5 1684 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrdcQ8BHG1 1161 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpm1Q2TV84 1622 aa17.09■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NpatQ8BMA5 1420 aa17.08■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa17.08■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa17.08■□□□□ 0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pak3Q61036 559 aa17.07■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Talpid3E9PV87 1520 aa17.07■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pank3Q8R2W9 370 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk26Q99JT2 416 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint5A7XUY5 1461 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13695A2AK44 830 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc4a3P16283 1227 aa17.05■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa17.04■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp5dQ9ES52 1191 aa17.04■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc4a1apE9PX68 744 aa17.03■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ino80Q6ZPV2 1559 aa17.03■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtl5Q5DTT4 599 aa17.03■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnga1P29974 684 aa17.02■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hfm1D3Z4R1 1434 aa17.02■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa17.02■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efcab6Q6P1E8 1516 aa17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stag3O70576 1240 aa17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Liat1Q810M6 228 aa17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rims1Q99NE5 1463 aa17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrxO55103 1391 aa17■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shq1Q7TMX5 569 aa16.99■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd1aE9PYH6 1716 aa16.98■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts7Q68SA9 1657 aa16.98■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tecpr2Q3UH45 1423 aa16.97■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D9H8 365 aa16.97■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa16.95■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh1E0CZ22 1640 aa16.95■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnh8P59111 1102 aa16.95■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif13aQ9EQW7 1749 aa16.95■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myom2Q14BI5 1463 aa16.94■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asxl2Q8BZ32 1370 aa16.94■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.93■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zranb1Q7M760 708 aa16.92■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprmP28828 1452 aa16.92■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan10Q3URR7 782 aa16.91■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ofd1Q80Z25 1017 aa16.91■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa16.91■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa16.91■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc2Q6P902 515 aa16.9■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q7TT23 1179 aa16.9■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IqubQ8CDK3 788 aa16.9■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egfem1Q8C088 590 aa16.9■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam184bQ0KK56 942 aa16.9■□□□□ 0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc7Q80TE7 1490 aa16.89■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nphp4P59240 1425 aa16.89■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc5P60904 198 aa16.89■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsph4aQ8BYM7 716 aa16.89■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RictorQ6QI06 1708 aa16.88■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyclP10166 368 aa16.88■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa16.88■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mink1Q9JM52 1308 aa16.87■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pola1P33609 1465 aa16.87■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa16.87■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 L3mbtl2P59178 703 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 637.1 ms