RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C POP4P38336 279 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C AIF1P52923 378 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SNZ1Q03148 297 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C GAS3Q03655 524 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C GIS3Q12418 502 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C NCB2Q92317 146 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C CDC7P06243 507 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MDH2P22133 377 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PRX1P34227 261 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C DSE2P38844 325 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.94□□□□□ -2.26not detected
HDA3YPR179C PGD1P40356 397 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C AGE2P40529 298 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PGA2P53903 129 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TCA17P32613 152 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MRPL28P36527 147 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SVP26P38869 228 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C ICE2P40499 491 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TIR3P40552 269 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PDR17P53844 350 aa0.94□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C GCN3P14741 305 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MRPS28P21771 286 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SKG1P36169 355 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SIP3P38717 1229 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YRB2P40517 327 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C IRC18P47056 224 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SWP1Q02795 286 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C BNA7Q04066 261 aa0.93□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C NTG1P31378 399 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SEC17P32602 292 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C UTP30P36144 274 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C BOL2P53082 120 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SML1Q04964 104 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MCP1Q12106 302 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YIL177CP40434 1758 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YJL225CP40889 1758 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TIM9O74700 87 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SEC4P07560 215 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data0.92□□□□□ -2.26not detected
HDA3YPR179C TAF14P35189 244 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MRPL17P36528 281 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RMD6P39975 231 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C AVT2P39981 480 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YNL217WP40152 326 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C DOC1P53068 250 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C BUD25P85052 153 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PET191Q02772 108 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YPL162CQ12042 273 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TSC3Q3E790 80 aa0.92□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TUS1Q06412 1307 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SPS18P32572 300 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PTM1P32857 523 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YET1P35723 206 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C UMP1P38293 148 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YBR219CP38317 127 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C IKI1P38874 309 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C AST2P39945 430 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YGR050CP53231 118 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YNR077CP53758 84 aa0.91□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C KSS1P14681 368 aa0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MER1P16523 270 aa0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C FZF1P32805 299 aa0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YKT6P36015 200 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YER135CP40082 130 aa0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C FLO9P39712 1322 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C PDR18P53756 1333 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C HTB1P02293 131 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C HTB2P02294 131 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YOL162WP0CF19 215 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C SNC2P33328 115 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YCR087C-AP37263 153 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C TRM5P38793 499 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C EAF6P47128 113 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C LSM7P53905 115 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YDR249CQ03787 373 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YOL160WQ08321 113 aa0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C RPL25P04456 142 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C URA5P13298 226 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C CBF1P17106 351 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C BET1P22804 142 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C YKR045CP36138 183 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C GAA1P39012 614 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C COG5P53951 403 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C CSI2Q08054 341 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C GPM2Q12008 311 aa0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
HDA3YPR179C MDM32Q12171 622 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 107.8 ms