RNA–Protein interactions for RNA: YHR130C

YHR130C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHR130C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR130CYHR130C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C SWP1Q02795 286 aa0.49□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C YDR248CQ03786 193 aa0.49□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C ATG31Q12421 196 aa0.49□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C NTF2P33331 125 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C YMR007WQ03675 126 aa0.48□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C PAM18Q07914 168 aa0.48□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C RRT8Q08219 342 aa0.48□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C YIL177CP40434 1758 aa0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C YJL225CP40889 1758 aa0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C TIM9O74700 87 aa0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C TSC3Q3E790 80 aa0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C TDA8Q6B2U8 126 aa0.47□□□□□ -2.33
YHR130CYHR130C MRPL28P36527 147 aa0.46□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C VMA22P38784 181 aa0.46□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C DID2P69771 204 aa0.46□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C ATG40Q99325 256 aa0.46□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C BCY1P07278 416 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C RPO26P20435 155 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C SNC2P33328 115 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C LDB7P38210 180 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YBR209WP38311 105 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C MCP1Q12106 302 aa0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C MRPL25P23369 157 aa0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C UTP30P36144 274 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C CUE1P38428 203 aa0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C PRE6P40303 254 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YFL065CP43539 102 aa0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C MRPL50P53724 139 aa0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C GPM2Q12008 311 aa0.44□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C SEC17P32602 292 aa0.43□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C OPY1P38271 328 aa0.43□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YLR173WQ06247 608 aa0.43□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C URA6P15700 204 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C SIP3P38717 1229 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C FLX1P40464 311 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C PRM8P53174 237 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C KRE28Q04431 385 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YOL160WQ08321 113 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C RAD28Q12021 506 aa0.42□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C SEC11P15367 167 aa0.41□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YUH1P35127 236 aa0.41□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C RCE1Q03530 315 aa0.41□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C YML108WQ03759 105 aa0.41□□□□□ -2.34
YHR130CYHR130C SPT3P06844 337 aa0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C MATALPHA1P0CY06 175 aa0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C HMLALPHA1P0CY07 175 aa0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C DBF2P22204 572 aa0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YCL042WP25572 119 aa0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C LIA1P47120 325 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C TCA17P32613 152 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YBR285WP38354 144 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C NUP84P52891 726 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C ALG13P53178 202 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YDR274CP87283 123 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C CWC27Q02770 301 aa0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.38□□□□□ -2.35not detected
YHR130CYHR130C SKG1P36169 355 aa0.38□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YHL042WP38729 150 aa0.38□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C INO80P53115 1489 aa0.37□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C SRL4Q03085 281 aa0.37□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YHR007C-AQ07074 71 aa0.37□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data0.36□□□□□ -2.35not detected
YHR130CYHR130C MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C APS1P35181 156 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YEL008WP40001 126 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YPL073CP40323 161 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C BXI1P48558 297 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YMR252CQ04814 134 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C CDC123Q05791 360 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa0.36□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C ATP15P21306 62 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C FMC1P40491 155 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YFH7P43591 353 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C FAR7P43592 221 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C RPC17P47076 161 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C FYV6P53913 173 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C PET117Q02771 107 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C YDR249CQ03787 373 aa0.35□□□□□ -2.35
YHR130CYHR130C MDM35O60200 86 aa0.34□□□□□ -2.36
YHR130CYHR130C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
YHR130CYHR130C MSN4P33749 630 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 94 ms