RNA–Protein interactions for RNA: YHL029C

OCA5, Transcript of Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus, yeast

Gene OCA5, Length 2,040 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA5	YHL029C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YKU70	P32807	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YOR062C	P36025	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ATG27	P46989	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YJR115W	P47152	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MSY1	P48527	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	BOL2	P53082	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YGR015C	P53208	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TAM41	P53230	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YIP3	P53633	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SEI1	Q06058	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SAC7	P17121	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MSS51	P32335	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	JHD1	P40034	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PIC2	P40035	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DLS1	P40366	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SHR5	P41912	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	UBC7	Q02159	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	BLS1	Q06071	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
OCA5	YHL029C	ISU2	Q12056	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	GEX2	P36173	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	UMP1	P38293	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	OXA1	P39952	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YIL165C	P40446	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	UBX6	P47049	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SKO1	Q02100	647 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ADD37	Q03233	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ASM4	Q05166	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	POS5	Q06892	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DCI1	Q08558	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CNE1	P27825	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAU2	P32612	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YCH1	P42937	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PET130	P47065	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DAD3	P69850	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SUE1	Q06524	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	BSC1	Q12140	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	INO4	P13902	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ZRT1	P32804	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CMC1	P36064	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MRP21	P38175	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YBR292C	P38357	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	EAF5	P39995	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SNO3	P43544	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	BNA2	P47125	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	XPT1	P47165	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SNO2	P53823	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SOR2	Q07786	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	FCY22	Q12119	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	COX1	P00401	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CYC3	P06182	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SPC29	P33419	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	NNK1	P36003	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DRE2	P36152	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPB11	P38902	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PSD1	P39006	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RRT5	P43607	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ERG25	P53045	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YNR014W	P53719	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YNL140C	P53910	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YLR460C	P54007	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YML079W	Q03629	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TSA2	Q04120	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TRI1	Q05024	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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