RNA–Protein interactions for RNA: YBR246W

RRT2, Transcript of Methylesterase performing penultimate step of diphthamide biosynthesis, yeast

Gene RRT2, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT2	YBR246W	MRP51	Q02950	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	HEM25	Q07534	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	SCP1	Q08873	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	COX1	P00401	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	CDC7	P06243	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	CKA1	P15790	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	NUP1	P20676	1076 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	TRS65	P32893	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
RRT2	YBR246W	GPX1	P36014	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	YBR013C	P38215	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	AME1	P38313	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	YBR220C	P38318	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	TAX4	P47030	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	BXI1	P48558	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	UBP8	P50102	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	AAH1	P53909	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	YLR152C	P54072	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	FIT1	Q04433	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	HRT1	Q08273	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRT2	YBR246W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	FUN14	P18411	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PEX4	P29340	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CLB6	P32943	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YOX1	P34161	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RIB5	P38145	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MED6	P38782	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ATF1	P40353	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	GPI15	P53961	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MRX8	Q05473	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MSC3	Q05812	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COQ11	Q05892	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RRT7	Q07829	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COQ10	Q08058	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	HRD1	Q08109	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RDR1	Q08904	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ATP5	P09457	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SPO7	P18410	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ADH7	P25377	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SNC2	P33328	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SDH4	P37298	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	POP8	P38208	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YAL037W	P39728	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SPC25	P40014	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SLZ1	P40167	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YIL067C	P40514	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	VMA21	P41806	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DAN1	P47178	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PKP2	P53170	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	TIM21	P53220	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ATP23	P53722	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ECM18	Q04623	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COX19	Q3E731	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	OPI3	P05375	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COQ3	P27680	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	AFG1	P32317	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DLS1	P40366	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	NAS2	P40555	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MSY1	P48527	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DIA1	P54005	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	NCE101	Q02820	53 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YML018C	Q03730	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CAB5	Q03941	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	STP3	Q05937	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RLM1	Q12224	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MCT1	Q12283	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	QCR2	P07257	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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