RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 LDS2Q08218 356 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 PUT1P09368 476 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 PPG1P32838 368 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 FIG1P38224 298 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YEL068CP39977 110 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 ENB1Q08299 606 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YCR075W-AQ3E830 75 aa8.57□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 TDH2P00358 332 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 BNA5Q05979 453 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YKL033W-AQ86ZR7 236 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MES1P00958 751 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YKR104WP0CE69 306 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MGA1P53050 456 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 RCE1Q03530 315 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 RKI1Q12189 258 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 HRT1Q08273 121 aa8.56□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 ICS2P38284 255 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 SKN7P38889 622 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 SMK1P41808 388 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 NPC2Q12408 173 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 IRC22P40006 225 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 FHN1P53279 174 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YML018CQ03730 393 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 PIN2Q12057 282 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MRS4P23500 304 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 FUN19P28003 413 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data8.55□□□□□ -1.04not detected
RDN25-2RDN25-2 TOA2P32774 122 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 OTU1P43558 301 aa8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 SMX3P54999 86 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 BGL2P15703 313 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 FLO5P38894 1075 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 SRB5P32585 307 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 UTR5P32630 166 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MSY1P48527 492 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YIP4P53093 235 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 DYN2Q02647 92 aa8.54□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 DPM1P14020 267 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MAK32P23060 363 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 AIM17P23180 465 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YHL044WP38727 235 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 TPC1P53257 314 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 CTF19Q02732 369 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 COQ11Q05892 277 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 PIN3Q06449 215 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MCK1P21965 375 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 VPS68Q12016 184 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 COX19Q3E731 98 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
RDN25-2RDN25-2 ILV5P06168 395 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 YNL208WP40159 199 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 MTO1P53070 669 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 APJ1P53940 528 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 TMA23Q03525 211 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 COQ10Q08058 207 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 HUT1Q12520 339 aa8.53□□□□□ -1.04
RDN25-2RDN25-2 CYC7P00045 113 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 MSW1P04803 379 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CDC40P40968 455 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CIN2P46670 268 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YGL262WP53054 175 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YHM2Q04013 314 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 SNO4Q04902 237 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 RDR1Q08904 546 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 HSP33Q08914 237 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 HSP32Q08992 237 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YDL211CQ12121 372 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 PAU19P0CE85 124 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 PAU21P0CE86 164 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 PAU22P0CE87 164 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 PAU3P25610 124 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CTR3Q06686 241 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 RPS13P05756 151 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 NHP6AP11632 93 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 DAD2P36162 133 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 SEC24P40482 926 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 BRR6P53062 197 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YNR061CP53747 219 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CTS2Q06350 511 aa8.52□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 PAI3P01094 68 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CDC36P06100 191 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 STE18P18852 110 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 TIM12P32830 109 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 WSS1P38838 269 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 BAT1P38891 393 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 SPC25P40014 221 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 COQ5P49017 307 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YLR456WQ06199 204 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 SPG5P42933 373 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CRZ1P53968 678 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 TPT1Q12272 230 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 MSB2P32334 1306 aa8.51□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 URK1P27515 501 aa8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 IKS1P47042 667 aa8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 RMD9P53140 646 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 CAB5Q03941 241 aa8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 OGG1P53397 376 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 ERP1Q05359 219 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RDN25-2RDN25-2 YOL024WQ08172 172 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.4 ms