RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	VPS63	O13549	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	CWP1	P28319	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TRS20	P38334	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MSY1	P48527	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	COQ5	P49017	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MTM1	P53320	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HHT1	P61830	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	NUP100	Q02629	959 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TDA6	Q06466	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SIA1	Q12212	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	THI2	P38141	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	POP1	P41812	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	BIT61	P47041	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	COQ11	Q05892	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	LOA1	Q06508	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SFG1	Q12507	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SAM35	P14693	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	STE18	P18852	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	POP5	P28005	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SPL2	P38839	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AXL2	P38928	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	GAA1	P39012	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	FIS1	P40515	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PRM8	P53174	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TYW3	P53177	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HST3	P53687	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AIM34	Q03673	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	GPB1	Q08886	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PER33	Q12144	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PAU3	P25610	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	CDC5	P32562	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PPZ2	P33329	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YBR063C	P38083	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TOS1	P38288	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	IRC22	P40006	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YER076C	P40049	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MSS11	Q03825	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	THI74	Q04083	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	XYL2	Q07993	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	NRT1	Q08485	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	IZH4	Q99393	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MAC1	P35192	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MOH1	P38191	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	COA1	P40452	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YFR057W	P43625	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AVT1	P47082	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YGR015C	P53208	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	BUD9	P53226	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RRG8	Q06109	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PLB3	Q08108	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MCP1	Q12106	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MCT1	Q12283	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ERV2	Q12284	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MYO1	P08964	1928 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	FCY2	P17064	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	GPI12	P23797	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MIC12	P38341	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPS6	P40583	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YIP1	P53039	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MTC3	P53077	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	APJ1	P53940	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AQR1	P53943	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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