RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	NDE2	Q07500	545 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	HEM25	Q07534	307 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRS3	P10566	314 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRS4	P23500	304 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	NDC1	P32500	655 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	RCN1	P36054	211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	BOL3	P39724	118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PHM8	P40025	321 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	AVT6	P40074	448 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	AGP3	P43548	558 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	FIN1	Q03898	291 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ASR1	Q06834	288 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	LOT6	Q07923	191 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	AEP3	Q12089	606 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	COX2	P00410	251 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	STF2	P16965	84 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YBL010C	P32788	280 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	MRPL36	P36531	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SWD3	P38123	315 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	SDS24	P38314	527 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
YNL057W	YNL057W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	FIT1	Q04433	528 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	PEX30	Q06169	523 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	TFC7	Q12415	435 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	YOS1	Q3E834	85 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL057W	YNL057W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	PEX4	P29340	183 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	SNC2	P33328	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	NRG2	P38082	220 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	UMP1	P38293	148 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	FMC1	P40491	155 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	PAM16	P42949	149 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YJR120W	P47157	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YDR274C	P87283	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	SPC24	Q04477	213 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YPD1	Q07688	167 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	ORT1	Q12375	292 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YCR101C	P25607	182 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	SRL3	P36167	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YBR285W	P38354	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	SSO2	P39926	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	BUD8	P41698	603 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YJL118W	P47022	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	HNT2	P49775	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YGL204C	P53089	101 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	IMO32	P53219	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	CRH1	P53301	507 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	GRX5	Q02784	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	ATG17	Q06410	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YPR1	Q12458	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	FUN26	P31381	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	ERG3	P32353	365 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	HYM1	P32464	399 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	VAM7	P32912	316 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	REC104	P33323	182 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	YHK8	P38776	514 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	MPC2	P38857	129 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	CIN4	P39110	191 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL057W	YNL057W	COX15	P40086	486 aa		3.38	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.5 ms