RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HMS1	Q12398	434 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RIP1	P08067	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MET3	P08536	511 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU19	P0CE85	124 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU21	P0CE86	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU22	P0CE87	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	CTA1	P15202	515 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	STE18	P18852	110 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	VMA16	P23968	213 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	STP22	P25604	385 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU3	P25610	124 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	EHD3	P28817	500 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	UMP1	P38293	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	EHT1	P38295	451 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	WSS1	P38838	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PHS1	P40857	217 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PMT3	P47190	753 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	TPC1	P53257	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ALG12	P53730	551 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RSM23	Q01163	450 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	VPS28	Q02767	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	COQ10	Q08058	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	NPC2	Q12408	173 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	IZH2	Q12442	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ERP4	Q12450	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MPD2	Q99316	277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	UBA3	Q99344	299 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MAK32	P23060	363 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	LSB5	P25369	354 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
SHH3	YMR118C	SLM6	P38343	150 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	IRC22	P40006	225 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	YFL054C	P43549	646 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU5	P43575	122 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	OST3	P48439	350 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	YGR066C	P53242	292 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	AQR1	P53943	586 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SAM50	P53969	484 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PET191	Q02772	108 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	THI74	Q04083	370 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MRL1	Q06815	381 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	BSC6	Q08280	497 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RLM1	Q12224	676 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SET6	Q12529	373 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
SHH3	YMR118C	OPI3	P05375	206 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	ATP5	P09457	212 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SPS4	P09937	338 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU1	P0CE88	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU14	P0CE89	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU6	P0CE90	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU18	P0CE91	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU8	P0CE92	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU11	P0CE93	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	CKA1	P15790	372 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	STE4	P18851	423 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	RPB8	P20436	146 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PTP1	P25044	335 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SEF1	P34228	1148 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	OM14	P38325	134 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	PAU13	P38725	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	MNL1	P38888	796 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	FLO5	P38894	1075 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	HSP10	P38910	106 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	UIP3	P39547	235 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	GAT2	P40209	560 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	OSW5	P40219	148 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	XBP1	P40489	647 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	GLC8	P41818	229 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SHH3	YMR118C	GWT1	P47026	490 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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