RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	FRE5	Q08908	694 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ATG31	Q12421	196 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SNF8	Q12483	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ADE8	P04161	214 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	DOA4	P32571	926 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	MRP8	P35719	219 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RCN1	P36054	211 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YKL077W	P36081	392 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YBR197C	P38306	217 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	HNT2	P49775	206 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YNL033W	P53964	284 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YNL019C	P53975	284 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	INP1	Q03694	420 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	OST6	Q03723	332 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	MRPL35	Q06678	367 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YPD1	Q07688	167 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	INP53	Q12271	1107 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YPS3	Q12303	508 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	PRR2	Q12310	699 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	VPS63	O13549	108 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SDS24	P38314	527 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	FLX1	P40464	311 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	LEM3	P42838	414 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SPC1	P46965	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	DCS1	Q06151	350 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	GPI11	Q06636	219 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.93	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	URA3	P03962	267 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.92	□□□□□ -2.26	not detected
IML1	YJR138W	CPR4	P25334	318 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SIP1	P32578	815 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YBR013C	P38215	129 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	TRS20	P38334	175 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YGR210C	P42942	411 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	QRI7	P43122	407 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	PIR5	P46999	287 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SNX4	P47057	423 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SGF11	Q03067	99 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YML122C	Q03207	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ASM4	Q05166	528 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	TFC7	Q12415	435 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	AAC1	P04710	309 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	STF2	P16965	84 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	VMA16	P23968	213 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SRL3	P36167	246 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	DOG2	P38773	246 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	DOG1	P38774	246 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YRB2	P40517	327 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	CCW12	Q12127	133 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	LSO1	Q3E827	93 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	HBN1	Q96VH4	193 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SIR2	P06700	562 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	FUN26	P31381	517 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	AAD14	P42884	376 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SPR6	Q01684	191 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	LDS2	Q08218	356 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	TMA17	Q12513	150 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	COX5B	P00425	151 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RAS1	P01119	309 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	PAU2	P32612	120 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RIB7	P33312	244 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YPC1	P38298	316 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YHK8	P38776	514 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SNF11	P38956	169 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	VAM3	Q12241	283 aa		0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	IMP1	P28627	190 aa		0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	NDC1	P32500	655 aa		0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ELF1	P36053	145 aa		0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	CTR2	P38865	189 aa		0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	RTT105	P40063	208 aa		0.91	□□□□□ -2.26
IML1	YJR138W	SYS1	P41544	203 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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