RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213WYHR213W MRPS16Q02608 121 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W DYN3Q04949 312 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YLR036CQ07986 203 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YPL278CQ08990 100 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W MSH5Q12175 901 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YOR029WQ12243 111 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W JLP1Q12358 412 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPN6Q12377 434 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SNF8Q12483 233 aa2.39□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ATP6P00854 259 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SEN2P16658 377 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W GIT1P25346 518 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ERG9P29704 444 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PMT2P31382 759 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W VPH2P32341 215 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RIB1P38066 345 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPS27BP38711 82 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W BIG1P38813 335 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W TRR2P38816 342 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W DDI1P40087 428 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W HPM1P40481 377 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W AGP3P43548 558 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W IGD1P43598 195 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PMT4P46971 762 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W MIG2P53035 382 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W CTF19Q02732 369 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YPL077CQ02831 240 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YDR476CQ03362 224 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PEX12Q04370 399 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SPC24Q04477 213 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W GAT3Q07928 141 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YPR202WQ08993 238 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.38□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W STT4P37297 1900 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W QCR2P07257 368 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ITR2P30606 609 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W MRPS5P33759 307 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W NUF2P33895 451 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W AIM2P39721 246 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ICE2P40499 491 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W CIN2P46670 268 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W TAD2P47058 250 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PAC10P48363 199 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YPS5P53057 165 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W OKP1P53298 406 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PRM15Q03262 622 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W DCR2Q05924 578 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YOL024WQ08172 172 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W AKR2Q12013 749 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YDL109CQ12103 647 aa2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W QCR7P00128 127 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W HTB2P02294 131 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W HEM4P06174 275 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YMR31P19955 123 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
YHR213WYHR213W MKK1P32490 508 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YKL162CP36052 402 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W MRPS9P38120 278 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W DTR1P38125 572 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W SHG1P38337 142 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YHR035WP38769 630 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W RBG1P39729 369 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ERG28P40030 148 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W POG1P40473 351 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W CUP9P41817 306 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W APS3P47064 194 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YGL262WP53054 175 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YGL159WP53110 370 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W CDH1P53197 566 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YNL033WP53964 284 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W YNL019CP53975 284 aa2.36□□□□□ -2.03
YHR213WYHR213W FSH2Q05015 223 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.4 ms