RNA–Protein interactions for RNA: YHR050W

SMF2, Transcript of Divalent metal ion transporter involved in manganese homeostasis, yeast

Gene SMF2, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMF2	YHR050W	ERV14	P53173	138 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	EST3	Q03096	181 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	DAL4	Q04895	635 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	TGS1	Q12052	315 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	DCN1	Q12395	269 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PET20	Q99373	253 aa		5	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	IFM1	P25038	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	FMT1	P32785	401 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PPZ2	P33329	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	CPR5	P35176	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SDH4	P37298	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SHG1	P38337	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SHO1	P40073	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	TOK1	P40310	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RFC2	P40348	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	AIM24	P47127	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PGU1	P47180	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PMT3	P47190	753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	TIM21	P53220	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	APJ1	P53940	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	MCT1	Q12283	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	POF1	P25576	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	CLB6	P32943	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	MIA40	P36046	403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	GPI16	P38875	610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SLM1	P40485	686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	REE1	P40893	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	VMA21	P41806	77 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SKP1	P52286	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	NIF3	P53081	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PKP2	P53170	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RNH201	P53942	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	GPI15	P53961	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YML018C	Q03730	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	FIT1	Q04433	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PDX1	P16451	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	POP8	P38208	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SPC25	P40014	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	GIS1	Q03833	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SYM1	Q06563	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	GRE1	Q08969	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	AKR2	Q12013	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RAD28	Q12021	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	BLM10	P43583	2143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	AFG1	P32317	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ERG3	P32353	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	DUT1	P33317	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SSS1	P35179	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	HXT14	P42833	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	OCA2	P53949	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ATG21	Q02887	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ISA2	Q12425	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	DAL82	P21705	255 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ERG8	P24521	451 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SCM4	P32564	187 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YBR013C	P38215	129 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YJR056C	P47115	236 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	AVT4	P50944	713 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YNR040W	P53736	256 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	SDC1	Q03323	175 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	CAB5	Q03941	241 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	RRT7	Q07829	113 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMF2	YHR050W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPL44	P19956	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SEC59	P20048	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPL4	P36517	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	OM14	P38325	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.9 ms