RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data1.88□□□□□ -2.11not detected
GCN4YEL009C HIS3P06633 220 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ADK1P07170 222 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SGA1P08019 549 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DSF1P0CX08 502 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YNR073CP0CX09 502 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MATALPHA1P0CY06 175 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SPS100P13130 326 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ERG24P32462 438 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CLB6P32943 380 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ZRT3P34240 503 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SFK1P35735 353 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FRM2P37261 193 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YBR220CP38318 560 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SSH1P38353 490 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YGP1P38616 354 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YHK8P38776 514 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RTT105P40063 208 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DLS1P40366 167 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ATG18P43601 500 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CIN2P46670 268 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YJL016WP47072 561 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SIP18P50263 79 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DOC1P53068 250 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YNR048WP53740 393 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AAH1P53909 347 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NRK1P53915 240 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CIK1Q01649 594 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YPL077CQ02831 240 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TDA1Q03533 586 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MSS11Q03825 758 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GPI17Q04080 534 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PEX30Q06169 523 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HEM25Q07534 307 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FIT3Q08907 204 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MSH5Q12175 901 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RNH203Q12338 110 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ISA2Q12425 185 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SUS1Q6WNK7 96 aa1.88□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL30P14120 105 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ARO3P14843 370 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HXT2P23585 541 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DEG1P31115 442 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HOM6P31116 359 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AFG1P32317 509 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C REC114P32841 428 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SNC2P33328 115 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MTR2P34232 184 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MIA40P36046 403 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TCM62P38228 572 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MBA1P38300 278 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PRS3P38689 320 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FCY21P40039 528 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FLX1P40464 311 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YIL029CP40538 142 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C OST1P41543 476 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SER2P42941 309 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C BNA6P43619 295 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PHB2P50085 310 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AVT4P50944 713 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C UBC13P52490 153 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YIP5P53108 310 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YGL159WP53110 370 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRH4P53166 561 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C POP6P53218 158 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ERV29P53337 310 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RNH201P53942 307 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HHT1P61830 136 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.87□□□□□ -2.11not detected
GCN4YEL009C SKO1Q02100 647 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDR391CQ04170 232 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YMR130WQ04223 302 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YPR098CQ06089 161 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MHR1Q06630 226 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRPL35Q06678 367 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RFU1Q08003 200 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ATG41Q12048 136 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data1.87□□□□□ -2.11not detected
GCN4YEL009C USB1Q12208 290 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ORT1Q12375 292 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MEC1P38111 2368 aa1.87□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS23BP0CX30 145 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MSI1P13712 422 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PET18P25362 215 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SPT14P32363 452 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GLC7P32598 312 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YKL187CP34231 750 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MCH2P36032 473 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRPL36P36531 177 aa1.86□□□□□ -2.11
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