RNA–Protein interactions for RNA: YDR349C

YPS7, Transcript of Putative GPI-anchored aspartic protease, yeastyeast

Gene YPS7, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS7YDR349C DML1Q03652 475 aa3.45□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YDR102CQ03864 110 aa3.45□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C VAM3Q12241 283 aa3.45□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YLR108CQ12259 485 aa3.45□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C HMS1Q12398 434 aa3.45□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MES1P00958 751 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YPK2P18961 677 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C UTR5P32630 166 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YJR012CP47087 207 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SOL1P50278 321 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C COS10P52924 374 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YNR062CP53748 327 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SMP3Q04174 516 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SPC3Q12133 184 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C FRE6Q12473 712 aa3.44□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C TDH2P00358 332 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.43□□□□□ -1.86not detected
YPS7YDR349C ATP10P18496 279 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PHO80P20052 293 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PEX32P38292 413 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YBR285WP38354 144 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C CHL4P38907 458 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C STB1P42845 420 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YFR035CP43608 114 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C HMS2P47175 358 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YMD8Q03697 442 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YDR286CQ05530 114 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C DCS1Q06151 350 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C GSH2Q08220 491 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C AEP3Q12089 606 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MCT1Q12283 360 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C OPI3P05375 206 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C IDP1P21954 428 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C OAC1P32332 324 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C REC114P32841 428 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PHD1P36093 366 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YPK3P38070 525 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ECM31P38122 312 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C EGD2P38879 174 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C FLX1P40464 311 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MSS2P40990 351 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C EOS1P53938 366 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SPO19Q03029 223 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ELP6Q04868 273 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PCL9Q12477 304 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YPL119C-AQ3E751 87 aa3.43□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C DSF1P0CX08 502 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YNR073CP0CX09 502 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YHR212W-AP0CX91 67 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PHO85P17157 305 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ROX3P25046 220 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RIO2P40160 425 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SYG1P40528 902 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YGL114WP53134 725 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C NNT1Q05874 261 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SIA1Q12212 622 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C TRM10Q12400 293 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MED11Q99278 115 aa3.42□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PET494P07390 489 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C VPH2P32341 215 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SUR1P33300 382 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
YPS7YDR349C MDM31P38880 579 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
YPS7YDR349C IPT1P38954 527 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C RTS2P40962 232 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ECM27P47144 725 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C XPT1P47165 209 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SNZ1Q03148 297 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C OST6Q03723 332 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ATX2Q12067 313 aa3.41□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MSW1P04803 379 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C SEN2P16658 377 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ACP1P32463 125 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C GOS1P38736 223 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PFS2P42841 465 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C OCA2P53949 197 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C MSC3Q05812 728 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C YPR098CQ06089 161 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C PHO92Q06390 306 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C ATG17Q06410 417 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C HRT1Q08273 121 aa3.4□□□□□ -1.86
YPS7YDR349C GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 84.9 ms