RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W TFC1P32367 649 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W DAD2P36162 133 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W VPS45P38932 577 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SEC28P40509 296 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W FIS1P40515 155 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YFH7P43591 353 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W COX16P47081 118 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ABZ2Q03266 374 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GAS3Q03655 524 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SFH1Q06168 426 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CCW12Q12127 133 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YOR029WQ12243 111 aa-0.75□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SIR2P06700 562 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W TAL1P15019 335 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YPT52P36018 234 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W JEN1P36035 616 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W MRX3P38172 270 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W FZO1P38297 855 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W APE4P38821 490 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YIL102CP40488 101 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W DOC1P53068 250 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SIA1Q12212 622 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YCT1Q12235 531 aa-0.76□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ILV1P00927 576 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W VMA8P32610 256 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YHL037CP38733 133 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W LRP1P38801 184 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W MNN9P39107 395 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W AIM20P40451 204 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W AGP3P43548 558 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YPL257WQ08974 193 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SKS1Q12505 502 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W COA3Q3E7B2 85 aa-0.77□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CDC8P00572 216 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CAR2P07991 424 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W POF1P25576 258 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W RPL5P26321 297 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W MRPL15P36523 253 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ECM33P38248 429 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W OPY1P38271 328 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W HIS2P38635 335 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W JEM1P40358 645 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W RPA43P46669 326 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CPD1P53314 239 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W TRM12Q04235 462 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ARV1Q06541 321 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GPN3Q06543 272 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YPR172WQ06608 200 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YHR007C-AQ07074 71 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YPR203WQ08994 102 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W PER33Q12144 273 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W FRE6Q12473 712 aa-0.78□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YET1P35723 206 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YBR209WP38311 105 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W VMA22P38784 181 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W TDA11P38854 504 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YAR068WP39564 161 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MEP1P40260 492 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YJR056CP47115 236 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W RMR1P53060 241 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MRH4P53166 561 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YDR391CQ04170 232 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YDR124WQ04608 324 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YLR307C-AQ3E825 87 aa-0.79□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W STH1P32597 1359 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YAR064WP39563 99 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W GCN20P43535 752 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YFL051CP43552 160 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W LOH1P47055 219 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W KAP114P53067 1004 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W EOS1P53938 366 aa-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MDM35O60200 86 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SEC11P15367 167 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W FCY2P17064 533 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W RPF1P38805 295 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W HHY1P39982 102 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W ALG11P53954 548 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W GOT1Q03554 138 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W BER1Q06688 274 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YOR186WQ08560 144 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W RAD28Q12021 506 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W PSF1Q12488 208 aa-0.81□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W TUS1Q06412 1307 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YLR157W-EP0CF00 54 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W DBF2P22204 572 aa-0.82□□□□□ -2.54
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