RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W MRH4P53166 561 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YLR460CP54007 376 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TPP1Q03796 238 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TVP18Q04767 167 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PEX27Q08580 376 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W FCY22Q12119 530 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W CUP2P15315 225 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W NAR1P23503 491 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PRE2P30656 287 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PGD1P40356 397 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PAM16P42949 149 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ADO1P47143 340 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W BOR1P53838 576 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YPL077CQ02831 240 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SCP1Q08873 200 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SLO1Q3E784 85 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SIR2P06700 562 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W NUP1P20676 1076 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W CDC50P25656 391 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W VMA5P31412 392 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MRPL4P36517 319 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YIL165CP40446 119 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W HXT9P40885 567 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YNL184CP53876 108 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W HXT11P54862 567 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MSS11Q03825 758 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SEI1Q06058 285 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TAZ1Q06510 381 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YPL257WQ08974 193 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W FLP1P03870 423 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MRPL44P19956 98 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data4.19□□□□□ -1.74not detected
YMR196WYMR196W ECT1P33412 323 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MIC12P38341 106 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YHC3P47040 408 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PEX10Q05568 337 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W IPK1Q06667 281 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MRPL35Q06678 367 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W BER1Q06688 274 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TRM13Q12383 476 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W COX1P00401 534 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PTC6P25646 442 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W HSP150P32478 413 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MBA1P38300 278 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MTC4P38335 694 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YPT31P38555 223 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PTH1P38876 190 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PAC2P39937 518 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W OXA1P39952 402 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MIT1P40002 666 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YIR035CP40579 254 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PAU12P53343 120 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W HCH1P53834 153 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W GMC1Q04399 608 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YPR109WQ06104 294 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ATG39Q06159 398 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W FEX2Q08991 375 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W MCP1Q12106 302 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TAD3Q9URQ3 322 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SAG1P20840 650 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TRS65P32893 560 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PAU24P38155 120 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W COX15P40086 486 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YNL194CP40169 301 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W BNA2P47125 453 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ARO8P53090 500 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W TRS23Q03784 219 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YOL073CQ08232 322 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ENB1Q08299 606 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YPL199CQ08954 240 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ATX2Q12067 313 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W RLM1Q12224 676 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SFG1Q12507 346 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W SUS1Q6WNK7 96 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ILV5P06168 395 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data4.18□□□□□ -1.74not detected
YMR196WYMR196W DAL82P21705 255 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YBR063CP38083 404 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W LSM4P40070 187 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W POP1P41812 875 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W YMR252CQ04814 134 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W HRT1Q08273 121 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W THI72Q08579 599 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W GPM1P00950 247 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ATP10P18496 279 aa4.17□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W RPB8P20436 146 aa4.17□□□□□ -1.74
YMR196WYMR196W ADH7P25377 361 aa4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms