RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	ECM29	P38737	1868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	EHD3	P28817	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MET22	P32179	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	HMT1	P38074	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPT10	P38146	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MIC12	P38341	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	EFM1	P38732	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	VAB2	P40003	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPS6	P40583	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SNM1	P40993	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SAY1	P53324	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ATG4	P53867	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	IBD2	P53892	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RHO4	Q00246	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	EMI1	Q04406	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TVP18	Q04767	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RNH203	Q12338	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	OPI3	P05375	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SGA1	P08019	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	OAC1	P32332	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
UBX2	YML013W	TFC7	Q12415	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SNF8	Q12483	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	STE4	P18851	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ATG15	P25641	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MRP17	P28778	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CHS7	P38843	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ERG28	P40030	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AYR1	P40471	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	FIS1	P40515	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SAS2	P40963	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RRT5	P43607	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YJR012C	P47087	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YGL101W	P53144	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	COG7	P53195	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YGR017W	P53210	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	FRE4	P53746	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YDR366C	P87287	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CYT2	Q00873	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
UBX2	YML013W	YOP1	Q12402	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PRM4	Q12498	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	EPT1	P22140	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SEC22	P22214	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CLB6	P32943	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SFK1	P35735	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	BNA4	P38169	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	FLX1	P40464	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	GAT1	P43574	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AVT1	P47082	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YJR149W	P47177	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AVT4	P50944	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AAT1	Q01802	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ROT1	Q03691	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NUP53	Q03790	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PLB3	Q08108	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	GPM2	Q12008	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ATG41	Q12048	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TMS1	Q12116	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	DST1	P07273	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TFS1	P14306	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YCR099C	P25657	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected

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