RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FPR4	YLR449W	FEX1	Q08913	375 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ERP4	Q12450	207 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SPS4	P09937	338 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SEN2	P16658	377 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	AGA2	P32781	87 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YBL010C	P32788	280 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	POP8	P38208	133 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YNR040W	P53736	256 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YDR248C	Q03786	193 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YCR101C	P25607	182 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YBR197C	P38306	217 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	STS1	P38637	319 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ATF1	P40353	525 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	BMT5	P40493	336 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MID1	P41821	548 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SSN8	P47821	323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPN14	P53196	417 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RCE1	Q03530	315 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	HUT1	Q12520	339 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	BLM10	P43583	2143 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ATG15	P25641	520 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	FAT1	P38225	669 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	LAG1	P38703	411 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	DID2	P69771	204 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	DLT1	Q04216	342 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	ANT1	Q06497	328 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RAF1	Q06891	181 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.24	□□□□□ -0.61	not detected
FPR4	YLR449W	ISN1	Q99312	450 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	UBA3	Q99344	299 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	NUM1	Q00402	2748 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	NAT2	P37293	288 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	UFD1	P53044	361 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YIP5	P53108	310 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	JAC1	P53193	184 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	NRG1	Q03125	231 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RTT103	Q05543	409 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YDL086W	Q07505	273 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	VAM3	Q12241	283 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	TFC7	Q12415	435 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YBR085C-A	O43137	85 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	QCR2	P07257	368 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SEC22	P22214	214 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MRPS5	P33759	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YER084W	P40057	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	TAD2	P47058	250 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	CAB5	Q03941	241 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SAG1	P20840	650 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MRP20	P32387	263 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	YOR186W	Q08560	144 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FPR4	YLR449W	MET3	P08536	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	MCH2	P36032	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	POP2	P39008	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	PRM5	P40476	318 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	PHB1	P40961	287 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	THI74	Q04083	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	GRC3	Q07845	632 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	FEX2	Q08991	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	MED4	Q12343	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	YIL029C	P40538	142 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	ISU1	Q03020	165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	YPR098C	Q06089	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	FIT3	Q08907	204 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	YCT1	Q12235	531 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	ATP14	Q12349	124 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	VMA3	P25515	160 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	OCH1	P31755	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	XBP1	P40489	647 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	UBP8	P50102	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	HEM4	P06174	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FPR4	YLR449W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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