RNA–Protein interactions for RNA: YLR250W

SSP120, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SSP120, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP120	YLR250W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PAU12	P53343	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	LIP2	Q06005	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	VAM3	Q12241	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YPR1	Q12458	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	FRE6	Q12473	712 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PET122	P10355	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MIG1	P27705	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	RCN1	P36054	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	CUE1	P38428	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MRX5	P47007	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YGL204C	P53089	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YGR151C	P53287	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	OKP1	P53298	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	BUD25	P85052	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	HOF1	Q05080	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
SSP120	YLR250W	TGS1	Q12052	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ORT1	Q12375	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	LAS17	Q12446	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ATG22	P25568	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	RPD3	P32561	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YKL063C	P35725	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MRPL36	P36531	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PAU24	P38155	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YJR056C	P47115	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	HSK3	P69852	69 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PEX30	Q06169	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	VCX1	Q99385	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	COX9	P07255	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	FAR1	P21268	830 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TCA17	P32613	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	AGA2	P32781	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YBL010C	P32788	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SNC2	P33328	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MTC2	P34246	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ECM4	P36156	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	UMP1	P38293	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SOH1	P38633	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	BNA1	P47096	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SLD3	P53135	668 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TLG1	Q03322	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MIX17	Q03667	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	UPS1	Q05776	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SOR2	Q07786	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	BBP1	Q12365	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PEX4	P29340	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ISC10	P32645	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	VAM7	P32912	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SWD3	P38123	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	MDJ2	P42834	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	RPA43	P46669	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TTI2	P47168	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	DAL4	Q04895	635 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ATG17	Q06410	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ATG40	Q99325	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ADE8	P04161	214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	SPS4	P09937	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SSP120	YLR250W	ELO2	P25358	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	PMU1	P36069	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	SPG4	Q04438	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	ECM18	Q04623	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	WHI5	Q12416	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	YLR358C	O13565	187 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	PHO85	P17157	305 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	PET18	P25362	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	PAU2	P32612	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	SFK1	P35735	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP120	YLR250W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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