RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	TGS1	Q12052	315 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	NUP1	P20676	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	IMG1	P25626	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YCR099C	P25657	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	CWP1	P28319	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SAF1	P38352	637 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RPP1	P38786	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	WSS1	P38838	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	IRC10	Q08118	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PUT1	P09368	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	HAP3	P13434	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	BOS1	P25385	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	GEX1	P25596	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PRY2	P36110	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	CHL4	P38907	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YAR1	P46683	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	BNS1	P50084	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YGR079W	P53249	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MET31	Q03081	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	ATC1	Q04005	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RRT7	Q07829	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MMT2	Q08970	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	GPM2	Q12008	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	BSC1	Q12140	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	FIG2	P25653	1609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SEC17	P32602	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SKN1	P33336	771 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MRPS9	P38120	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RTT102	P53330	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SHS1	Q07657	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SWM1	Q12379	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	COX5B	P00425	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	EPT1	P22140	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	ADH7	P25377	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PHO90	YJL198W	YPC1	P38298	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MNL1	P38888	796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MET30	P39014	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	OPT1	P40897	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	IGO1	P53897	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	NRK1	P53915	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PHO90	YJL198W	PET20	Q99373	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	VPS63	O13549	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	COX5A	P00424	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	TRM9	P49957	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YGR042W	P53227	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YGR126W	P53274	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RSM23	Q01163	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	FIT1	Q04433	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	IES4	Q08561	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
PHO90	YJL198W	TPO4	Q12256	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	LDB7	P38210	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	VPS52	P39904	641 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	ADD37	Q03233	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	INP1	Q03694	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	AVO2	Q04749	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	HAP2	P06774	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MRS4	P23500	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	HMX1	P32339	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PHO11	P35842	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RIB5	P38145	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	MRP21	P38175	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PHO12	P38693	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	DBP8	P38719	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	PAU15	P40585	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	EFM6	P53970	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	GIM5	Q04493	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHO90	YJL198W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms