RNA–Protein interactions for RNA: YJL024C

APS3, Transcript of Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3, yeast

Gene APS3, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APS3	YJL024C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
APS3	YJL024C	FSH3	Q99369	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	HNM1	P19807	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	REC114	P32841	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	SEN34	P39707	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	FLX1	P40464	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	YFL051C	P43552	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	SIP18	P50263	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	AVT4	P50944	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	YIP5	P53108	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	VBA1	Q04301	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	RFU1	Q08003	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	RDI1	Q12434	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	ERP4	Q12450	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APS3	YJL024C	URA3	P03962	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	AAC1	P04710	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SAG1	P20840	650 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MAK32	P23060	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PEX4	P29340	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YBL010C	P32788	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	VAM7	P32912	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YKL063C	P35725	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MCH2	P36032	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GPI16	P38875	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GWT1	P47026	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	OKP1	P53298	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ALG12	P53730	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CRR1	Q05790	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SYM1	Q06563	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PET20	Q99373	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PUT1	P09368	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MSI1	P13712	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CPR4	P25334	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	FIG1	P38224	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YHL037C	P38733	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	VMA22	P38784	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PIC2	P40035	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	UFD1	P53044	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RSM27	P53305	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	DLT1	Q04216	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	TDA6	Q06466	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	COX17	Q12287	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	TRM13	Q12383	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ARG80	P07249	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MET3	P08536	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	IFM1	P25038	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MRP17	P28778	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ERG3	P32353	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CLB6	P32943	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SSN8	P47821	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
APS3	YJL024C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RNH203	Q12338	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	REP2	P03872	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	POP8	P38208	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RRF1	P38771	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YIL029C	P40538	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	NIF3	P53081	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ORM1	P53224	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GIM3	P53900	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YML018C	Q03730	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	COA4	Q05809	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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