RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	BOP2	Q06150	570 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	ATG17	Q06410	417 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	PAM18	Q07914	168 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	HRT1	Q08273	121 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MMS1	Q06211	1407 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	DNF3	Q12674	1656 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	PPH21	P23594	369 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SFC1	P33303	322 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	ECM13	P38195	257 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	GOS1	P38736	223 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	PIR5	P46999	287 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	HOC1	P47124	396 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YPR098C	Q06089	161 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	DRS2	P39524	1355 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	TRM3	Q07527	1436 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	FMC1	P40491	155 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SNZ3	P43545	298 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MDM34	P53083	459 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YPR011C	Q12251	326 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RAD10	P06838	210 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MSN4	P33749	630 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	LDB7	P38210	180 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	TEM1	P38987	245 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YJR079W	P47126	109 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SPG4	Q04438	115 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YOR268C	Q08734	132 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YCT1	Q12235	531 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MAL32	P38158	584 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.86	□□□□□ -1.95	not detected
RPC17	YJL011C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MRH4	P53166	561 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MAL12	P53341	584 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YPR096C	O13587	100 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RPO26	P20435	155 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SPT8	P38915	602 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YER188W	P40103	239 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	MRPL50	P53724	139 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SNZ2	P53824	298 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	GEP5	Q12393	293 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SWI1	P09547	1314 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RAD9	P14737	1309 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SEC22	P22214	214 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RNP1	P32385	249 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	SGE1	P33335	543 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YAP3	P38749	330 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	GON7	P46984	123 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	KRE28	Q04431	385 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	YDR124W	Q04608	324 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	PST1	Q12355	444 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPC17	YJL011C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	BCK1	Q01389	1478 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YCR102C	P25608	368 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YKR032W	P36127	104 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	FZO1	P38297	855 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	CAB4	P53332	305 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	RSM10	Q03201	203 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	GOT1	Q03554	138 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YLR283W	Q05867	314 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	SLD7	Q08457	257 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YKL075C	P36083	450 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	DRE2	P36152	348 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YER085C	P40058	173 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	DIA1	P54005	336 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	MIX17	Q03667	156 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	EMP46	Q12396	444 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	SNF2	P22082	1703 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	SGA1	P08019	549 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	YOR186W	Q08560	144 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	KRE5	P22023	1365 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPC17	YJL011C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.7 ms