RNA–Protein interactions for RNA: YHR153C

SPO16, Transcript of Meiosis-specific protein involved in synaptonemal complex assembly, yeast

Gene SPO16, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO16	YHR153C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	COY1	P34237	679 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	YKR032W	P36127	104 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	RAD3	P06839	778 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	COS2	P0CX12	379 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	COS3	P0CX13	379 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	KRE1	P17260	313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	MRX3	P38172	270 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	YHL049C	P38722	271 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	NIF3	P53081	288 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	CTS2	Q06350	511 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	ATG17	Q06410	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	RRT8	Q08219	342 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO16	YHR153C	POX1	P13711	748 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YLR173W	Q06247	608 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	MED4	Q12343	284 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YHR045W	P38775	560 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YER084W	P40057	128 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	CSM4	Q08955	156 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	CWP1	P28319	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	QRI5	P32344	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	UTR5	P32630	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YJL028W	P47062	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RRN5	Q02983	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	PST1	Q12355	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	AGC1	Q12482	902 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	PPH21	P23594	369 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RNP1	P32385	249 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	FZO1	P38297	855 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	ASI3	P53983	676 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	IRA2	P19158	3079 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	ECM13	P38195	257 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	BIG1	P38813	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	BNA6	P43619	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	MRPL50	P53724	139 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	BOP2	Q06150	570 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	SLD7	Q08457	257 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	MAL32	P38158	584 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	MAL12	P53341	584 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	SRL4	Q03085	281 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	PLB3	Q08108	686 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	USE1	P53146	245 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	KRE28	Q04431	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO16	YHR153C	ECM29	P38737	1868 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
SPO16	YHR153C	JEN1	P36035	616 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	MRH4	P53166	561 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	EMI1	Q04406	187 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	SPO77	Q06134	477 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	PAM18	Q07914	168 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	MSH5	Q12175	901 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	RAD10	P06838	210 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	FMC1	P40491	155 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPO16	YHR153C	GLG2	P47011	380 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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