RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	NNT1	Q05874	261 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	TLG2	Q08144	397 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	AGC1	Q12482	902 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SRY1	P36007	326 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YER121W	P40076	114 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RRG9	P40156	214 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	OAC1	P32332	324 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ACP1	P32463	125 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ZRT3	P34240	503 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	CSG2	P35206	410 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ECM34	P38728	170 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	PEX17	P40155	199 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YGL260W	P53056	76 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YGR018C	P53211	109 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ABF2	Q02486	183 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	GRX8	Q05926	109 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SLD7	Q08457	257 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YPS3	Q12303	508 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	KDX1	P36005	433 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ARN2	P38724	620 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YER189W	P40104	122 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YKE4	P40544	346 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	MEP2	P41948	499 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RSM27	P53305	110 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	BOR1	P53838	576 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	DID2	P69771	204 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YMD8	Q03697	442 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.47	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	MRS1	P07266	363 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	TRX3	P25372	127 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	MEI4	P29467	408 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YOX1	P34161	385 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	TEM1	P38987	245 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	JAC1	P53193	184 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	NUP49	Q02199	472 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	TVP15	Q03860	143 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	PLP1	Q04004	230 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YML096W	Q04489	525 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	PST1	Q12355	444 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	EMP46	Q12396	444 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.46	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	COX4	P04037	155 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	COS2	P0CX12	379 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	COS3	P0CX13	379 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	CPT1	P17898	393 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	ECM13	P38195	257 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	POP7	P38291	140 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YHL044W	P38727	235 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	RMD6	P39975	231 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	RRT13	P40042	185 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	SYS1	P41544	203 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	CAT5	P41735	233 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	COS4	P43542	379 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	MCH1	Q07376	486 aa		3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	DER1	P38307	211 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	SPL2	P38839	148 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YPI1	P43587	155 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YGL235W	P53071	178 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	CAX4	P53223	239 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	ERV29	P53337	310 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	MAK3	Q03503	176 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	SPC2	Q04969	178 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	NSL1	Q12143	216 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.44	□□□□□ -1.86
VMA22	YHR060W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.44	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 143.7 ms