RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SIR2P06700 562 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C COX9P07255 59 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SSA3P09435 649 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRP1P10662 321 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DBF2P22204 572 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PRE7P23724 241 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PCL1P24867 279 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ATG15P25641 520 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AHC2P25649 128 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL5P26321 297 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ITR1P30605 584 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ACH1P32316 526 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DOA4P32571 926 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C VPS17P32913 551 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRPS5P33759 307 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SPT10P35208 640 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RSM22P36056 628 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PAU24P38155 120 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FMP23P38231 175 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PEX32P38292 413 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SEN34P39707 275 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AVT7P40501 490 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TIR3P40552 269 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PAM16P42949 149 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MOB2P43563 287 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CCC1P47818 322 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MTM1P53320 366 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MKC7P53379 596 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SAM50P53969 484 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SRL4Q03085 281 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RCE1Q03530 315 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RCF1Q03713 159 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GRX3Q03835 250 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDR387CQ04162 555 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MGR3Q04472 501 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YMR252CQ04814 134 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRX8Q05473 314 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TSR2Q06672 205 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RAF1Q06891 181 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RCN2Q12044 265 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MCT1Q12283 360 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C IES3Q12345 250 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C IZH2Q12442 317 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RTN2Q12443 393 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YPR1Q12458 312 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YLR099W-AQ3E798 87 aa1.9□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C QCR7P00128 127 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C COX5BP00425 151 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MES1P00958 751 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GCN4P03069 281 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C REP1P03871 373 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SCEIP03882 235 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CDC31P06704 161 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NAM2P11325 894 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPI1P23250 407 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DBF20P32328 564 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PAU2P32612 120 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CLG1P35190 452 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RCN1P36054 211 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data1.89□□□□□ -2.11not detected
GCN4YEL009C PHD1P36093 366 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GPX2P38143 162 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YBR096WP38256 230 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YBR137WP38276 179 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YHL037CP38733 133 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YER084WP40057 128 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PUG1P40100 303 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C JLP2P40206 208 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPR2P40571 144 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GDS1P41913 522 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YFL051CP43552 160 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YJL055WP47044 245 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C LOH1P47055 219 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PMT5P52867 743 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YGL204CP53089 101 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YLR152CP54072 576 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RSM23Q01163 450 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C API2Q04413 109 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GPN3Q06543 272 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ASR1Q06834 288 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SSK1Q07084 712 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PEX27Q08580 376 aa1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
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