RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	LDS1	P31379	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YEF1	P32622	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VAM7	P32912	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RRN10	P38204	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MET30	P39014	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MCM22	P47167	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	TOS2	P50078	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PHB2	P50085	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VEL1	P53058	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	COG7	P53195	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BNA5	Q05979	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PEX30	Q06169	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SOR2	Q07786	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	FSH3	Q99369	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PUT1	P09368	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	SEC22	P22214	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
VHS1	YDR247W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	VHT1	P53241	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
VHS1	YDR247W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	NAT4	Q04751	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	COX9	P07255	59 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PHO2	P07269	559 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	REV1	P12689	985 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	GPI12	P23797	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	SFK1	P35735	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	UIP5	P36137	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ECM34	P38728	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	VPS52	P39904	641 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ICE2	P40499	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YHC3	P47040	408 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	BNA7	Q04066	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	APA2	P22108	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	DOA1	P36037	715 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YKL162C	P36052	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MRPL4	P36517	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PEX32	P38292	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	IKI1	P38874	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	POP2	P39008	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PGD1	P40356	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	GTT1	P40582	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MRX5	P47007	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MOG1	P47123	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	SSN8	P47821	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YGR042W	P53227	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PCP1	P53259	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	NRK1	P53915	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	DGK1	Q12382	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PRM4	Q12498	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ZRC1	P20107	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	RPB5	P20434	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MAL32	P38158	584 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	RSM27	P53305	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MAL12	P53341	584 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	FYV6	P53913	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	MSB2	P32334	1306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	ADE1	P27616	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	YIL152W	P40455	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	NSE4	P43124	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHS1	YDR247W	SFH5	P47008	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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