RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W RSC58Q07979 502 aa9.62□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W ATG22P25568 528 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YBR220CP38318 560 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W UFD1P53044 361 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W RSM27P53305 110 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YPR098CQ06089 161 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W MRL1Q06815 381 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W WTM2Q12206 467 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W HUT1Q12520 339 aa9.61□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W SAG1P20840 650 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YIL029CP40538 142 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W SSN8P47821 323 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W ARG5,6Q01217 863 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W DLT1Q04216 342 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YPR196WQ06595 470 aa9.6□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W REP2P03872 296 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W ACH1P32316 526 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W MRPL36P36531 177 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YER079WP40052 210 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W SKP1P52286 194 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W GPG1P53130 126 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W TYW3P53177 273 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YNL092WP53934 400 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W MRPS16Q02608 121 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W YLR125WQ12138 136 aa9.59□□□□□ -0.87
RNQ1YCL028W RPL25P04456 142 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPS31P05759 152 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SPS4P09937 338 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W HNM1P19807 563 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RFA1P22336 621 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W BOL3P39724 118 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data9.58□□□□□ -0.88not detected
RNQ1YCL028W YDC1Q02896 317 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YOR186WQ08560 144 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YOR385WQ08909 290 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W EAF3Q12432 401 aa9.58□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SAR1P20606 190 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W NAT2P37293 288 aa9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W FAT1P38225 669 aa9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PRS3P38689 320 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W CRZ1P53968 678 aa9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YML018CQ03730 393 aa9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YDR248CQ03786 193 aa9.57□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W AAC1P04710 309 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SSA3P09435 649 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W GRX2P17695 143 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W IFM1P25038 676 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PPQ1P32945 549 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SRL3P36167 246 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YGP1P38616 354 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W EGT2P42835 1041 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W LSM1P47017 172 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W VBA1Q04301 562 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PIN3Q06449 215 aa9.56□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W ERG3P32353 365 aa9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W FIG1P38224 298 aa9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SKO1Q02100 647 aa9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PET20Q99373 253 aa9.55□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YLL053CP0CD98 152 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPS23BP0CX30 145 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PET122P10355 254 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W SPS100P13130 326 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YCR101CP25607 182 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W PEX4P29340 183 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W AGA2P32781 87 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W FMT1P32785 401 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W GWT1P47026 490 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W ALG9P53868 555 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W TRM13Q12383 476 aa9.54□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W URA3P03962 267 aa9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W RPL43BP0CX26 92 aa9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W DIT1P21623 536 aa9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W YMR254CQ04838 102 aa9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W GAT3Q07928 141 aa9.53□□□□□ -0.88
RNQ1YCL028W CPR4P25334 318 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MRX5P47007 382 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W TAF4P50105 388 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W PRM15Q03262 622 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YMR279CQ03263 540 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W SYM1Q06563 197 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W FCY22Q12119 530 aa9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W IMP1P28627 190 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MRP17P28778 131 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W MTR2P34232 184 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YKL107WP34251 309 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W FLO10P36170 1169 aa9.51□□□□□ -0.89
RNQ1YCL028W YBR197CP38306 217 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms