RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ITGA10O75578 1167 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SREBF1P36956 1147 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 DUSP2Q05923 314 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 RUNDC1Q96C34 613 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 MVB12AQ96EY5 273 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 MAP3K14Q99558 947 aa6.35□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 UBE2QL1A1L167 161 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 VSTM5A8MXK1 200 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 AMY1AP04745 511 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 NPEPPSP55786 919 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ATP8B2P98198 1209 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRDN-204ENST00000542443 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZRM9 215 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TTC7BQ86TV6 843 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRDN-204ENST00000542443 REPS2Q8NFH8 660 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRDN-204ENST00000542443 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DRC7Q8IY82 874 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MDM1Q8TC05 714 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.32□□□□□ -1.4
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