RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPE3	YPR069C	PMT6	P42934	759 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	PIR5	P46999	287 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	YDL186W	P48568	277 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	AVT4	P50944	713 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	YMR166C	Q03829	368 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	FIN1	Q03898	291 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	TMA10	Q06177	86 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPE3	YPR069C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	COX9	P07255	59 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	FAR1	P21268	830 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SDS22	P36047	338 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	NAT2	P37293	288 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ALG14	P38242	237 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YND1	P40009	630 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YGL204C	P53089	101 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SCW11	P53189	542 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ECM18	Q04623	453 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	FRE6	Q12473	712 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ENA1	P13587	1091 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ATP10	P18496	279 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PEP12	P32854	288 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MKS1	P34072	584 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YCR041W	P37265	110 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SDS24	P38314	527 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	AGE2	P40529	298 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MRH4	P53166	561 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	LIP2	Q06005	328 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SOR2	Q07786	357 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YOL114C	Q12322	202 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	IMP1	P28627	190 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	VPS17	P32913	551 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MTC2	P34246	357 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	CUE1	P38428	203 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YLF2	P38746	405 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	NTA1	P40354	457 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MDJ2	P42834	146 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SSN8	P47821	323 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ERP6	P53198	216 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	POP6	P53218	158 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PAU12	P53343	120 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	UPS1	Q05776	175 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YLR346C	Q06139	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ISU2	Q12056	156 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	TAF3	Q12297	353 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MRPL36	P36531	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MRX5	P47007	382 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YGR045C	P53229	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	OKP1	P53298	406 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	GRX5	Q02784	150 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PEX30	Q06169	523 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	EAF3	Q12432	401 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	HUT1	Q12520	339 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YLR358C	O13565	187 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YBR285W	P38354	144 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	AIM46	P38885	310 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SLD3	P53135	668 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	COX18	P53239	316 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	HLR1	Q04429	423 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	BBP1	Q12365	385 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YPR1	Q12458	312 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PEX4	P29340	183 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	FUN26	P31381	517 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	DOA4	P32571	926 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	SNC2	P33328	115 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	CPR5	P35176	225 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	RCN1	P36054	211 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PAU24	P38155	120 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PAC2	P39937	518 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	BUD8	P41698	603 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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