RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	EFM1	P38732	585 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YHR035W	P38769	630 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	IRC18	P47056	224 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	OST3	P48439	350 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	MST27	P53176	234 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	FMN1	Q03778	218 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	TRS23	Q03784	219 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SWF1	Q04629	336 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SUT2	Q12286	268 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	EPT1	P22140	391 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	OCH1	P31755	480 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YEF1	P32622	495 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	COX13	P32799	129 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	TVP38	P36164	337 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	CBP4	P37267	147 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YBR137W	P38276	179 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SDS24	P38314	527 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YBR242W	P38331	238 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RBG1	P39729	369 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	ARG2	P40360	574 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	FIS1	P40515	155 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	GAT1	P43574	510 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	HMS2	P47175	358 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	NMA2	P53204	395 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	CSN9	Q03981	162 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	GAT3	Q07928	141 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	FYV7	Q12247	151 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	HRT3	Q12347	344 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	GPA2	P10823	449 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	BAR1	P12630	587 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	CDC43	P18898	376 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	MGT1	P26188	188 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	INO2	P26798	304 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YKL075C	P36083	450 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YBR056W	P38081	501 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	ATG12	P38316	186 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	NDT80	P38830	627 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	KEG1	P43614	200 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	MRM2	P53123	320 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	PCP1	P53259	346 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	UBC7	Q02159	165 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SWP1	Q02795	286 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	BNA5	Q05979	453 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SSK1	Q07084	712 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	OSW1	Q08692	278 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YOP1	Q12402	180 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SUC2	P00724	532 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TFS1	P14306	219 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FCY2	P17064	533 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	STE4	P18851	423 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	NUP1	P20676	1076 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TRX3	P25372	127 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CPR3	P25719	182 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FUN26	P31381	517 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ARO7	P32178	256 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SFK1	P35735	353 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SPC34	P36131	295 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRPL28	P36527	147 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	APL3	P38065	1025 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YMC2	P38087	329 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ROT2	P38138	954 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPC1	P38298	316 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YBR285W	P38354	144 aa		3.46	□□□□□ -1.86

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