RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YSR3	P23501	404 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	IFM1	P25038	676 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	CSM1	P25651	190 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YNL260C	P53846	198 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	ERV41	Q04651	352 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	VPS68	Q12016	184 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GAL7	P08431	366 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	RPB9	P27999	122 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GPX1	P36014	167 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	TPO5	P36029	618 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	AIM18	P38884	321 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YIR035C	P40579	254 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GDS1	P41913	522 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YGL185C	P53100	379 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	CAX4	P53223	239 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	BCP1	Q06338	283 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	CPT1	P17898	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	AEP1	P32493	518 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	FMT1	P32785	401 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YKL063C	P35725	167 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	RPC37	P36121	282 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YBR062C	P38239	180 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GTO1	P48239	356 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	RSM10	Q03201	203 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ASR1	Q06834	288 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PLB3	Q08108	686 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ATP6	P00854	259 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	CUP2	P15315	225 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	MEI4	P29467	408 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	MRPL6	P32904	214 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	MRPL37	P36532	105 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	HIS2	P38635	335 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	TDA11	P38854	504 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	CYC2	P38909	366 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YIA6	P40556	373 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	AGP3	P43548	558 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	VTI1	Q04338	217 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	EMI1	Q04406	187 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	SLD7	Q08457	257 aa		3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PHO13	P19881	312 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	AIM29	P36154	155 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YEL073C	P39974	107 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ZRG17	P53735	605 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GPN3	Q06543	272 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	POM33	Q12164	279 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PRM7	Q12459	698 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	VPH2	P32341	215 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	AST1	P35183	429 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YKL070W	P36087	169 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PRY2	P36110	329 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GPI8	P49018	411 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PEX30	Q06169	523 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	TFS1	P14306	219 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	TAF14	P35189	244 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	LDB7	P38210	180 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PEX18	P38855	283 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YIL086C	P40503	102 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	LDB18	Q07887	179 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	FMP16	Q12497	93 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	SEY1	Q99287	776 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTD1	YKR080W	IMP1	P28627	190 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	MRPL3	P36516	390 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	YIL059C	P40520	121 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	YIL012W	P40551	113 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	YFL064C	P43540	174 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	COS4	P43542	379 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTD1	YKR080W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.9 ms