RNA–Protein interactions for RNA: YKR029C

SET3, Transcript of Defining member of the SET3 histone deacetylase complex, yeast

Gene SET3, Length 2,256 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET3	YKR029C	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SET3	YKR029C	FMP27	Q06179	2628 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	FKS3	Q04952	1785 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ATG15	P25641	520 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	IME2	P32581	645 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	AGA2	P32781	87 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	COY1	P34237	679 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SPL2	P38839	148 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SUR2	P38992	349 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	PRM9	P39551	298 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YJL118W	P47022	219 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MIG2	P53035	382 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MRPL50	P53724	139 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	APJ1	P53940	528 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RRN5	Q02983	363 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	OST6	Q03723	332 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YDR222W	Q04925	415 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	DXO1	Q06349	442 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YOL107W	Q12239	342 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YPS3	Q12303	508 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	PRR2	Q12310	699 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	COX2	P00410	251 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RAD3	P06839	778 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	CDC42	P19073	191 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RRT12	P25381	491 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	CAB3	P36076	571 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SCC4	P40090	624 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YNL095C	P53932	642 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SDC1	Q03323	175 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	GTO3	Q04806	366 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ATG17	Q06410	417 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	TIM22	Q12328	207 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ATG5	Q12380	294 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SNF2	P22082	1703 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MET2	P08465	486 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	POX1	P13711	748 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YKR032W	P36127	104 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	HMT1	P38074	348 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
SET3	YKR029C	FZO1	P38297	855 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ATG12	P38316	186 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	BNA6	P43619	295 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YAR1	P46683	200 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	NIF3	P53081	288 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YGL088W	P53151	121 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MAL13	P53338	473 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YLR173W	Q06247	608 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	CTS2	Q06350	511 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ARV1	Q06541	321 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RRT8	Q08219	342 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SLD7	Q08457	257 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	PST1	Q12355	444 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SNF8	Q12483	233 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	NUP192	P47054	1683 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MSF1	P08425	469 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	CWP1	P28319	239 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ARN2	P38724	620 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	TEM1	P38987	245 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SPO73	P40031	143 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	FMC1	P40491	155 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SER33	P40510	469 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	DSN1	P40568	576 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YJL144W	P47009	104 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	AAH1	P53909	347 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SWS2	P53937	143 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	ASI3	P53983	676 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	TAO3	P40468	2376 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	FAB1	P34756	2278 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MIG1	P27705	504 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	QRI5	P32344	111 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	RNP1	P32385	249 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SFC1	P33303	322 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	SGE1	P33335	543 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	CSG2	P35206	410 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	MRPL39	P36533	70 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SET3	YKR029C	YHL049C	P38722	271 aa		0.87	□□□□□ -2.27

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