RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YLR162W	Q06235	118 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.55	□□□□□ -2.32	not detected
YKL063C	YKL063C	FLO9	P39712	1322 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	STH1	P32597	1359 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	COX5A	P00424	153 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.54	□□□□□ -2.32	not detected
YKL063C	YKL063C	VPS45	P38932	577 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	ERG25	P53045	309 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	LSB1	P53281	241 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	MNT4	P53745	580 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	OAC1	P32332	324 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	HSM3	P38348	480 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	COS8	P38723	381 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YGR219W	P53307	113 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	MAL13	P53338	473 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YNL260C	P53846	198 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SPO19	Q03029	223 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	REX3	Q12090	404 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	VMA11	P32842	164 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	BLI1	P35727	113 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ERV15	P38312	142 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	AVT2	P39981	480 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	AGE2	P40529	298 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	FMP33	P46998	180 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	PEX18	P38855	283 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	MGR3	Q04472	501 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SML1	Q04964	104 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	MDY2	Q12285	212 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YHR180W	P38868	163 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YGL159W	P53110	370 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YGR026W	P53217	278 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ARP5	P53946	755 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	CTF19	Q02732	369 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SHC1	P39000	512 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YKE4	P40544	346 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	BCP1	Q06338	283 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	UPS2	P35200	230 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	YNR062C	P53748	327 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ASI3	P53983	676 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	BUD25	P85052	153 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SPP2	Q02521	185 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	ERV41	Q04651	352 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	NEJ1	Q06148	342 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	FMP16	Q12497	93 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YKL063C	YKL063C	SIR4	P11978	1358 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	TCD1	P38756	429 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YER189W	P40104	122 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	COA1	P40452	197 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YMR279C	Q03263	540 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YLR462W	O13556	202 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	EHD3	P28817	500 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YEL075C	P39972	122 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	SNZ3	P43545	298 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	QCR8	P08525	94 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YJR012C	P47087	207 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	ERV29	P53337	310 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	OST6	Q03723	332 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	ARR2	Q06597	130 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	STF1	P01098	86 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	MSW1	P04803	379 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	QRI5	P32344	111 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YDR124W	Q04608	324 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	DSN1	P40568	576 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	GOT1	Q03554	138 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	ATG39	Q06159	398 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	HEM25	Q07534	307 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	VAR1	P02381	398 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	GPA2	P10823	449 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	YKL070W	P36087	169 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	MRX5	P47007	382 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	MRH4	P53166	561 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	GTR2	P53290	341 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YKL063C	YKL063C	OPI1	P21957	404 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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