RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SPC3	Q12133	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MGR1	P25573	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	NAM9	P27929	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DTR1	P38125	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	APQ12	P40532	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	TAD2	P47058	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	IBA57	P47158	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SDT1	P53078	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SAY1	P53324	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SNX41	Q04053	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DCR2	Q05924	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MDM30	Q05930	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PER33	Q12144	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	QCR7	P00128	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	KIN28	P06242	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PTP1	P25044	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ITR1	P30605	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SRB6	P32570	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DOA4	P32571	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ECM15	P35195	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	KKQ8	P36004	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	IML3	P38265	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	COS8	P38723	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	WSS1	P38838	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PHB1	P40961	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PRM10	P42946	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YGR026W	P53217	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ASI3	P53983	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	GAS2	Q06135	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	KEI1	Q06346	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	TMS1	Q12116	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	TPO4	Q12256	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YRM1	Q12340	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SCEI	P03882	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PRB1	P09232	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	HNM1	P19807	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SEC62	P21825	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YSR3	P23501	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YCR100C	P25606	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ATS1	P31386	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PAU2	P32612	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DAD2	P36162	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	LOH1	P47055	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SNN1	P48232	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ANT1	Q06497	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	REX4	Q08237	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	EAF3	Q12432	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	STE7	P06784	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BUB3	P26449	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MRP17	P28778	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ECM25	P32525	599 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SUA5	P32579	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ECT1	P33412	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	HEM14	P40012	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BMT5	P40493	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SAS2	P40963	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RAD17	P48581	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YGL159W	P53110	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YGL101W	P53144	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CGR1	P53188	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CDH1	P53197	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	HHO1	P53551	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MEH1	Q02205	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PNG1	Q02890	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ODC1	Q03028	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BTS1	Q12051	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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