RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	PRY2	P36110	329 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RIB5	P38145	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TRS20	P38334	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PHO12	P38693	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MNL1	P38888	796 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	AVT7	P40501	490 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	POP1	P41812	875 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MEP2	P41948	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
VBA2	YBR293W	PEX31	P53203	462 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RTT102	P53330	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	GOT1	Q03554	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CTR3	Q06686	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CRD1	Q07560	283 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	COQ10	Q08058	207 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	COX19	Q3E731	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	HMX1	P32339	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	REC104	P33323	182 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PMU1	P36069	295 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YPC1	P38298	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PFS1	P38872	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YEL057C	P39983	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	IRC22	P40006	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YER188W	P40103	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ELO3	P40319	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PAM16	P42949	149 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	QRI7	P43122	407 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SPP2	Q02521	185 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	EST3	Q03096	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YML018C	Q03730	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	UPS3	Q04006	179 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	BNA5	Q05979	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CNL1	Q06333	122 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PAU23	Q07987	124 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CSI2	Q08054	341 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	IES4	Q08561	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	NAT5	Q08689	176 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PAU17	Q12370	124 aa		4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SAL1	D6W196	494 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MSW1	P04803	379 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ATS1	P31386	333 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	AFG1	P32317	509 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	HOG1	P32485	435 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	LOT5	P34234	306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MRPS9	P38120	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PAU24	P38155	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	LDB7	P38210	180 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ICS2	P38284	255 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ARP1	P38696	384 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YHL041W	P38730	149 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	GPI16	P38875	610 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YEL028W	P39989	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SPC25	P40014	221 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YER158C	P40095	573 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MET28	P40573	187 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MIC26	P50087	233 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YGR126W	P53274	230 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	CRF1	Q04930	467 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	ATG33	Q06485	197 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	SHS1	Q07657	551 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	IRC10	Q08118	586 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	BSC1	Q12140	328 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VBA2	YBR293W	PCL9	Q12477	304 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.4 ms