RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C MRS4P23500 304 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C TCA17P32613 152 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SKG1P36169 355 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C TIR3P40552 269 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MTL1P53214 551 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SWA2Q06677 668 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RFU1Q08003 200 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C THP1Q08231 455 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RFM1Q12192 310 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C VCX1Q99385 411 aa2.88□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C STF2P16965 84 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ERV1P27882 189 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NUF2P33895 451 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C FLO10P36170 1169 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PRE3P38624 215 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YNR048WP53740 393 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YDR274CP87283 123 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YMR087WQ04299 284 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NCA2Q12374 616 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RIB3Q99258 208 aa2.87□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YCR051WP25631 222 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C IMP1P28627 190 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ZRT3P34240 503 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PMU1P36069 295 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ECM27P47144 725 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PMT5P52867 743 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YMR254CQ04838 102 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MDM36Q06820 579 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C FRE3Q08905 711 aa2.86□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SAL1D6W196 494 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ISC10P32645 267 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C LTV1P34078 463 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C FRM2P37261 193 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RIB1P38066 345 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YHR218WP38899 603 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YND1P40009 630 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C HIS6P40545 261 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YGR210CP42942 411 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MSE1P48525 536 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C COS10P52924 374 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YGL101WP53144 215 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C CRH1P53301 507 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SAM50P53969 484 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YPL067CQ02754 198 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PEX12Q04370 399 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ARP10Q04549 284 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YLR173WQ06247 608 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MCH1Q07376 486 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C GRC3Q07845 632 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C PRM3Q08931 133 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NFI1Q12216 726 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C JID1Q12350 301 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C BBP1Q12365 385 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.85□□□□□ -1.95not detected
SUP53tL(CAA)C MHF2Q3E829 80 aa2.85□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C REP2P03872 296 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ATG22P25568 528 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C RPC82P32349 654 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ECM31P38122 312 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C IPT1P38954 527 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C AAD14P42884 376 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C IDS2P46958 469 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SAM37P50110 327 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C SOL1P50278 321 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YGL159WP53110 370 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C TOS8P53147 276 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C MRH4P53166 561 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C OKP1P53298 406 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C CAB4P53332 305 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YKR005CQ02203 525 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C YMR181CQ03231 154 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C DYN3Q04949 312 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C NSL1Q12143 216 aa2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SUP53tL(CAA)C TAR1Q8TGM6 124 aa2.84□□□□□ -1.95
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