RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	GET4	Q12125	312 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	YKL075C	P36083	450 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	FZO1	P38297	855 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	COX15	P40086	486 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	YNL194C	P40169	301 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	MIC19	P43594	170 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	PEX10	Q05568	337 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	ATG17	Q06410	417 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YJL028W	YJL028W	PCL1	P24867	279 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	RPB9	P27999	122 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CUE1	P38428	203 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SNZ3	P43545	298 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YGL118C	P53132	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YGR018C	P53211	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SNZ2	P53824	298 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YDL144C	Q07589	356 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SGE1	P33335	543 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	HMT1	P38074	348 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ECM34	P38728	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YLR152C	P54072	576 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SNZ1	Q03148	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	TSA2	Q04120	196 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	FLO11	P08640	1367 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	COS2	P0CX12	379 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	COS3	P0CX13	379 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
YJL028W	YJL028W	YPK2	P18961	677 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PHO80	P20052	293 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	COX10	P21592	462 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	TAF14	P35189	244 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	AVT6	P40074	448 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YIL054W	P40524	105 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	COS4	P43542	379 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CPR7	P47103	393 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	MIC26	P50087	233 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	HAL1	Q01766	294 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SPG4	Q04438	115 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CDC123	Q05791	360 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	DXO1	Q06349	442 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PSK1	P31374	1356 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CBF1	P17106	351 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	APA2	P22108	325 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PHO89	P38361	574 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	TRM9	P49957	279 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ERG2	P32352	222 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	UTH1	P36135	365 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YRB2	P40517	327 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SYS1	P41544	203 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	UFE1	P41834	346 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ALG13	P53178	202 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	CAX4	P53223	239 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	AAH1	P53909	347 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	MCH1	Q07376	486 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ATG5	Q12380	294 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SIR4	P11978	1358 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SSO1	P32867	290 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	DRE2	P36152	348 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	ARN2	P38724	620 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YJR149W	P47177	404 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	UFD1	P53044	361 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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