RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	MRX4	Q12467	430 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SNT2	P53127	1403 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MRS1	P07266	363 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MET2	P08465	486 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	EPT1	P22140	391 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YCR100C	P25606	316 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	OAC1	P32332	324 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	KAR9	P32526	644 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YBR062C	P38239	180 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	NVJ1	P38881	321 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YNR048W	P53740	393 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	ARK1	P53974	638 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	HSK3	P69852	69 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PEX30	Q06169	523 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SSK1	Q07084	712 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SLM3	Q12093	417 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	COX5A	P00424	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MDM10	P18409	493 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	CDC43	P18898	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YCR007C	P25354	239 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SNC1	P31109	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RMD6	P39975	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RRG9	P40156	214 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YIL067C	P40514	678 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YFL064C	P43540	174 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	BCH1	Q05029	724 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	IRC10	Q08118	586 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RFM1	Q12192	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MCT1	Q12283	360 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	STH1	P32597	1359 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	EDE1	P34216	1381 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YOR1	P53049	1477 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GCN3	P14741	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	NMT1	P14743	455 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ERD1	P16151	362 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SFK1	P35735	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	LEU5	P38702	357 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ECM14	P38836	430 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PET8	P38921	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MST28	P39552	234 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ARG2	P40360	574 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	XBP1	P40489	647 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	AZF1	P41696	914 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TIM8	P57744	87 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SWP1	Q02795	286 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YML108W	Q03759	105 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	INM2	Q05533	292 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SEI1	Q06058	285 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	HMS1	Q12398	434 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TRM10	Q12400	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PEX11	Q12462	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	OCH1	P31755	480 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	EFM1	P38732	585 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	DFG10	P40526	253 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	CPR7	P47103	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MCM22	P47167	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ORC5	P50874	479 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TDA1	Q03533	586 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	CSN9	Q03981	162 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TAF9	Q05027	157 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	BNA5	Q05979	453 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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