RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	MDM31	P38880	579 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RRG9	P40156	214 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BXI1	P48558	297 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TPN1	P53099	579 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COG7	P53195	279 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ARK1	P53974	638 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MAK3	Q03503	176 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SCS7	Q03529	384 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BCH1	Q05029	724 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COQ10	Q08058	207 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AIM39	Q08223	395 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	THI20	Q08224	551 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MCT1	Q12283	360 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PEX11	Q12462	236 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GCN3	P14741	305 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	HSP30	P25619	332 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	OAC1	P32332	324 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SRY1	P36007	326 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AVT5	P38176	459 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
SLX8	YER116C	PET8	P38921	284 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GWT1	P47026	490 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	IKS1	P47042	667 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MCM22	P47167	239 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AVT4	P50944	713 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	DYN2	Q02647	92 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RMI1	Q02685	241 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMR206W	Q03695	313 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SLM3	Q12093	417 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RFM1	Q12192	310 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	FRE8	Q12209	686 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ERV2	Q12284	196 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	DRS2	P39524	1355 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CCH1	P50077	2039 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MRS1	P07266	363 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	EPT1	P22140	391 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AGA1	P32323	725 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	FRM2	P37261	193 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YBR062C	P38239	180 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MED8	P38304	223 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SLM6	P38343	150 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	LEU5	P38702	357 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SPL2	P38839	148 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AZF1	P41696	914 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	UFE1	P41834	346 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PHO23	P50947	330 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TOS8	P53147	276 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SPG4	Q04438	115 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SEI1	Q06058	285 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BSC1	Q12140	328 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PCL9	Q12477	304 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SNT2	P53127	1403 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MET2	P08465	486 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMC1	P32331	307 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YPT53	P36019	220 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MRP21	P38175	177 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CHS7	P38843	316 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PEX22	P39718	180 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RMD6	P39975	231 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	EGT2	P42835	1041 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GAT1	P43574	510 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	VPS25	P47142	202 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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