RNA–Protein interactions for RNA: YDR349C

YPS7, Transcript of Putative GPI-anchored aspartic protease, yeastyeast

Gene YPS7, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS7YDR349C YHR180WP38868 163 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C HXT14P42833 540 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C PAC10P48363 199 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C ATG26Q06321 1198 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C SOR2Q07786 357 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C MCH4Q08268 501 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C YOL131WQ08270 108 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C FIT3Q08907 204 aa3.6□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C TIM9O74700 87 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C TFC1P32367 649 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C STP2P38704 541 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C AIM2P39721 246 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C HPM1P40481 377 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C YFR054CP43622 192 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C DSL1P53847 754 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C FIN1Q03898 291 aa3.59□□□□□ -1.83
YPS7YDR349C PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PUT2P07275 575 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C NAM2P11325 894 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C CNA1P23287 553 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C HOT13P36078 116 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YBR096WP38256 230 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PHO90P39535 881 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C GEP7P53171 287 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C GET1P53192 235 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C GPI1P53306 609 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C DBP6P53734 629 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YNL033WP53964 284 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YNL019CP53975 284 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YMR102CQ03177 834 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ACL4Q03771 387 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SPC2Q04969 178 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YLR345WQ06137 509 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RRT8Q08219 342 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C OSW1Q08692 278 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ADF1Q2V2Q1 113 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RPL5P26321 297 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PUP2P32379 260 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SWH1P35845 1188 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YCR041WP37265 110 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YHR218WP38899 603 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MAM33P40513 266 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C UFD1P53044 361 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ATP23P53722 227 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RSM23Q01163 450 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C THP1Q08231 455 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MED2Q12124 431 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SFM1Q12314 213 aa3.58□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PET9P18239 318 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C CMK2P22517 447 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PEX3P28795 441 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YPS7YDR349C YBR241CP38142 488 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C CUE1P38428 203 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MTW1P39731 289 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C IRC7P43623 340 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YIP5P53108 310 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YNL095CP53932 642 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PEX12Q04370 399 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C BSC1Q12140 328 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C NFI1Q12216 726 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C IZH2Q12442 317 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MHF2Q3E829 80 aa3.57□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RAD7P06779 565 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MER1P16523 270 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C STE50P25344 346 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C IES6P32617 166 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C GPX1P36014 167 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YGR201CP42936 225 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C GPI8P49018 411 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C MRP51Q02950 344 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SPO77Q06134 477 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ORM2Q06144 216 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C IRC25Q07951 179 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ACH1P32316 526 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SKG1P36169 355 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C ILM1P47155 203 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C UBP8P50102 471 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C INP1Q03694 420 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C CTS2Q06350 511 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C FRE3Q08905 711 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YDL199CQ12407 687 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.56□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C SEC66P33754 206 aa3.55□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C NUF2P33895 451 aa3.55□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C COS9P36034 407 aa3.55□□□□□ -1.84
YPS7YDR349C RIB1P38066 345 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms