RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SUT2	Q12286	268 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	AHC1	Q12433	566 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CDC7	P06243	507 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	HIP1	P06775	603 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CDC34	P14682	295 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GPI12	P23797	304 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	IFM1	P25038	676 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ADE1	P27616	306 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MSK1	P32048	576 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YEF1	P32622	495 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MAL32	P38158	584 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
SHH3	YMR118C	RRN10	P38204	145 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PEX32	P38292	413 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SHG1	P38337	142 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	OCA5	P38738	679 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PEX28	P38848	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PHO90	P39535	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	VPS52	P39904	641 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PZF1	P39933	429 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	EMC5	P40540	141 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YFR020W	P43600	232 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SFH5	P47008	294 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YHC3	P47040	408 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TOS2	P50078	622 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YGL117W	P53133	265 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CDH1	P53197	566 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	OKP1	P53298	406 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MAL12	P53341	584 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	BSC5	P53755	489 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PEX25	Q02969	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SNO1	Q03144	224 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NAT4	Q04751	285 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	DCN1	Q12395	269 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TFC7	Q12415	435 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CBS1	P14066	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPK2	P18961	677 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YSR3	P23501	404 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CPR5	P35176	225 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SSS1	P35179	80 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ECM15	P35195	104 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	UIP5	P36137	443 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	BET3	P36149	193 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPC1	P38298	316 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ECM34	P38728	170 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SLM1	P40485	686 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SYS1	P41544	203 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	VMA21	P41806	77 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CIN2	P46670	268 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SOL1	P50278	321 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SGF73	P53165	657 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TYW3	P53177	273 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GPI15	P53961	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MEH1	Q02205	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FIT1	Q04433	528 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SUL2	Q12325	893 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	GAL4	P04386	881 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HIS5	P07172	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CHO1	P08456	276 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SEC59	P20048	519 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RPB5	P20434	215 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PBN1	P25580	416 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	BUB3	P26449	341 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	DBF20	P32328	564 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SSH4	P32343	579 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PPZ2	P33329	710 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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