RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	SUC2	P00724	532 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	OCH1	P31755	480 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PHD1	P36093	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MMT2	Q08970	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RBG1	P39729	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	UFD1	P53044	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HCH1	P53834	153 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HSK3	P69852	69 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TSA2	Q04120	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SDH7	Q04401	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BNA5	Q05979	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
STB2	YMR053C	SUT2	Q12286	268 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MRX4	Q12467	430 aa		4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CDC7	P06243	507 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PPH21	P23594	369 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	AIM26	P32858	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FRM2	P37261	193 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CBP4	P37267	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SCO2	P38072	301 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	KRE29	P40026	464 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FAR7	P43592	221 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	KEG1	P43614	200 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CTH1	P47976	325 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TPN1	P53099	579 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SFH1	Q06168	426 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SAL1	D6W196	494 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TFS1	P14306	219 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FCY2	P17064	533 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MRPS28	P21771	286 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SRY1	P36007	326 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BIR1	P47134	954 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YGR017W	P53210	297 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ERG5	P54781	538 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MAK3	Q03503	176 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HCM1	P25364	564 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ECM14	P38836	430 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YIL067C	P40514	678 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MCM22	P47167	239 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BUD32	P53323	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	NCA2	Q12374	616 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MRS1	P07266	363 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	GPA2	P10823	449 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	CLB2	P24869	491 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	ATG12	P38316	186 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	MDM31	P38880	579 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	PEX7	P39108	375 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	MOB2	P43563	287 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YIP4	P53093	235 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	TOS8	P53147	276 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	INM2	Q05533	292 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	TRM10	Q12400	293 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	PSF1	Q12488	208 aa		4.03	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	REP1	P03871	373 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	CYC3	P06182	269 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	INO2	P26798	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YBR220C	P38318	560 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	NDT80	P38830	627 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	RFC2	P40348	353 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	PEX30	Q06169	523 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	HRD1	Q08109	551 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	ERD1	P16151	362 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	SCO1	P23833	295 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
STB2	YMR053C	HYM1	P32464	399 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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