RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	MOH1	P38191	138 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ARP1	P38696	384 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
PAM18	YLR008C	WSC4	P38739	605 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YAL037W	P39728	267 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	VPS52	P39904	641 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	OXA1	P39952	402 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YER076C	P40049	302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YNL320W	P42840	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ASG7	P46993	209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TAD2	P47058	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	JAC1	P53193	184 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CPD1	P53314	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YNL095C	P53932	642 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TIM44	Q01852	431 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DYN2	Q02647	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CCE1	Q03702	353 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YML108W	Q03759	105 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HSP31	Q04432	237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GLO2	Q05584	274 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GRX8	Q05926	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YLR031W	Q07978	186 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SGT1	Q08446	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HMS1	Q12398	434 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TPK3	P05986	398 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SPT3	P06844	337 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PMT2	P31382	759 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ZRT1	P32804	376 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	VAM7	P32912	316 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	OAR1	P35731	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	IST2	P38250	946 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CUE1	P38428	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TDA11	P38854	504 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GAA1	P39012	614 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PHM8	P40025	321 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SHO1	P40073	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HPM1	P40481	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TDA10	P42938	290 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YJL016W	P47072	561 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	UBC11	P52492	156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HER2	Q03557	464 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	AIM34	Q03673	198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SNX41	Q04053	625 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NEJ1	Q06148	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CTR3	Q06686	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	FLO11	P08640	1367 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HEM15	P16622	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SLY1	P22213	666 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ACB1	P31787	87 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TOA2	P32774	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YPT10	P38146	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PCL5	P38794	229 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YFL040W	P43562	540 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GUF1	P46943	645 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NUP57	P48837	541 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	USE1	P53146	245 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MTM1	P53320	366 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	COS6	P53344	381 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	AAT1	Q01802	451 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DPP1	Q05521	289 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MCH4	Q08268	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ICT1	Q12385	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	AGC1	Q12482	902 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HEM2	P05373	342 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	CTA1	P15202	515 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	TYR1	P20049	452 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PAM18	YLR008C	SEC22	P22214	214 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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