RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	YGR266W	P53326	701 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RSM28	Q03430	361 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	DCR2	Q05924	578 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YLR456W	Q06199	204 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RLM1	Q12224	676 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RDI1	Q12434	202 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SET6	Q12529	373 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CDC23	P16522	626 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RPB8	P20436	146 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CNE1	P27825	502 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NAM9	P27929	486 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	HSP150	P32478	413 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RPC34	P32910	317 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YKL063C	P35725	167 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YHR122W	P38829	231 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CHS7	P38843	316 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NAS2	P40555	220 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YFR054C	P43622	192 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YGL204C	P53089	101 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MTM1	P53320	366 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MRPL1	Q04599	285 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	COX20	Q04935	205 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YNG1	Q08465	219 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	INP53	Q12271	1107 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	BBP1	Q12365	385 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RTR2	Q12378	196 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.87	□□□□□ -1.47	not detected
MIA40	YKL195W	YOS9	Q99220	542 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	STE50	P25344	346 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	STP22	P25604	385 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SDS24	P38314	527 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RRF1	P38771	230 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YHR210C	P38893	341 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SPG5	P42933	373 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	GPG1	P53130	126 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	VHT1	P53241	593 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	GIM3	P53900	129 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SNX41	Q04053	625 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MRX8	Q05473	314 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YLR283W	Q05867	314 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	IRC19	Q07843	230 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	HNT3	Q08702	217 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MSW1	P04803	379 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	HOM3	P10869	527 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CDC26	P14724	124 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	STE18	P18852	110 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PMT2	P31382	759 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	EMP70	P32802	667 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PDR3	P33200	976 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SEF1	P34228	1148 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	UTH1	P36135	365 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	TIR3	P40552	269 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YFL054C	P43549	646 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	UBX6	P47049	396 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ASK10	P48361	1146 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YDR249C	Q03787	373 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	BNA7	Q04066	261 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NNT1	Q05874	261 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SEI1	Q06058	285 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	KEI1	Q06346	221 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YLR031W	Q07978	186 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RAX1	Q08760	435 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YOR343C	Q12484	108 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ERG4	P25340	473 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	APL3	P38065	1025 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	VMA7	P39111	118 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PHM8	P40025	321 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	BAP3	P41815	604 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SNX4	P47057	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ECM27	P47144	725 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	LCL3	P53153	274 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MTL1	P53214	551 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YGR042W	P53227	271 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YLR152C	P54072	576 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CTF19	Q02732	369 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PEX25	Q02969	394 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	FRE3	Q08905	711 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	FSH3	Q99369	266 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	OPI3	P05375	206 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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