RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	NDC1	P32500	655 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SPC29	P33419	253 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MTC2	P34246	357 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	DTR1	P38125	572 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YIL029C	P40538	142 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	EGT2	P42835	1041 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	PEF1	P53238	335 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SAM50	P53969	484 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	TLG1	Q03322	224 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	RNH203	Q12338	110 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	GEP5	Q12393	293 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.12	□□□□□ -1.43	not detected
TRR2	YHR106W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.11	□□□□□ -1.43	not detected
TRR2	YHR106W	YML003W	P0CF16	290 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	RPC34	P32910	317 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	FRM2	P37261	193 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	AAD14	P42884	376 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	CTK2	P46962	323 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	ABM1	P47146	123 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MTL1	P53214	551 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	VOA1	P53262	265 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SLI1	P53304	468 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YLR346C	Q06139	101 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YLR173W	Q06247	608 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	BRE4	Q07660	1125 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	FRE6	Q12473	712 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MED11	Q99278	115 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	COX5B	P00425	151 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	REP1	P03871	373 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	COX9	P07255	59 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.1	□□□□□ -1.43	not detected
TRR2	YHR106W	RTG1	P32607	177 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	THI2	P38141	450 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MSS2	P40990	351 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SAY1	P53324	424 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YDC1	Q02896	317 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	FIN1	Q03898	291 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	GAL83	Q04739	417 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	ERP4	Q12450	207 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SOD2	P00447	233 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.09	□□□□□ -1.43	not detected
TRR2	YHR106W	YKR015C	P36111	568 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SHE1	P38200	338 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SDP1	P40479	209 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YIR020C	P40575	100 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	PMT6	P42934	759 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	NCA3	P46955	337 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	CIK1	Q01649	594 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	DLT1	Q04216	342 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	SNA4	Q07549	140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	YOL114C	Q12322	202 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	ISA2	Q12425	185 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRR2	YHR106W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	KIN28	P06242	306 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	APA2	P22108	325 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	HXT2	P23585	541 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	PCL1	P24867	279 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	REC114	P32841	428 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	VPS17	P32913	551 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	SDS22	P36047	338 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	GOS1	P38736	223 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	FLX1	P40464	311 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	CIN2	P46670	268 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	YGL204C	P53089	101 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	TYW3	P53177	273 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	PAU12	P53343	120 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	YNR048W	P53740	393 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	AAH1	P53909	347 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	GRX5	Q02784	150 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	YPL077C	Q02831	240 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	GPI17	Q04080	534 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	YPR098C	Q06089	161 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	RFU1	Q08003	200 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	QCR7	P00128	127 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	YOX1	P34161	385 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TRR2	YHR106W	MCH2	P36032	473 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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