RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	LSB5	P25369	354 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SRY1	P36007	326 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MRPL28	P36527	147 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RIM2	P38127	377 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PCL5	P38794	229 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	NDT80	P38830	627 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	EXO1	P39875	702 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RTS2	P40962	232 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	UFE1	P41834	346 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	AIM23	P47015	356 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YJR030C	P47101	745 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	UBC13	P52490	153 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TOS8	P53147	276 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	COS6	P53344	381 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PDR17	P53844	350 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RHO4	Q00246	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	DYN2	Q02647	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	BET5	Q03630	159 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TPO4	Q12256	659 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RIB3	Q99258	208 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	REP1	P03871	373 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SPT3	P06844	337 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SEC22	P22214	214 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	COQ3	P27680	312 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	FRM2	P37261	193 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MED8	P38304	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SER33	P40510	469 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YIA6	P40556	373 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TDA10	P42938	290 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	GAT1	P43574	510 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PMT4	P46971	762 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	VHT1	P53241	593 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	FYV6	P53913	173 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SWS2	P53937	143 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	DYN3	Q04949	312 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	DPP1	Q05521	289 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	GLO2	Q05584	274 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	NEJ1	Q06148	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	LOA1	Q06508	300 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YLR031W	Q07978	186 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	AKR2	Q12013	749 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	BBP1	Q12365	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	POM152	P39685	1337 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	CDC8	P00572	216 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	IFM1	P25038	676 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TRX3	P25372	127 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YCR101C	P25607	182 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SPC34	P36131	295 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YMC2	P38087	329 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YBR137W	P38276	179 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MDM31	P38880	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YIL169C	P40442	995 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	HPM1	P40481	377 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YIL029C	P40538	142 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TPN1	P53099	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SWC4	P53201	476 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YMD8	Q03697	442 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	COQ10	Q08058	207 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YAP7	Q08182	245 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	DAS2	Q12084	232 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	KIN28	P06242	306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	CAP2	P13517	287 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MGT1	P26188	188 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	ARO7	P32178	256 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YEF1	P32622	495 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	FRE2	P36033	711 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	MRPL3	P36516	390 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SLM6	P38343	150 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YHI9	P38765	294 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	HCH1	P53834	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	NUP100	Q02629	959 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	PET191	Q02772	108 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	SCS7	Q03529	384 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SMI1	YGR229C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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