RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YCL012CQ8J0M4 134 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ADE4P04046 510 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SPE1P08432 466 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YFL068WP0CX99 160 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLL066W-AP0CY00 160 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLL067W-AP0CY01 160 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CUP2P15315 225 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CKS1P20486 150 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W OCH1P31755 480 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RER2P35196 286 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YBR096WP38256 230 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PSD1P39006 500 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SNM1P40993 198 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TAH11P47112 604 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W STE24P47154 453 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GTR2P53290 341 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W APS2Q00381 147 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W UBX3Q12229 455 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TRM10Q12400 293 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W VPS63O13549 108 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DAL82P21705 255 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YCR061WP25639 631 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PPZ1P26570 692 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ACB1P31787 87 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DOG2P38773 246 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PPE1P38796 400 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PAC2P39937 518 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HPA3P39979 161 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MAF1P41910 395 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DAD3P69850 94 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ECM9Q02202 377 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TMA23Q03525 211 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YML018CQ03730 393 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PPN1Q04119 674 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ATG33Q06485 197 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RGT2Q12300 763 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SAL1D6W196 494 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W THP2O13539 261 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SIS1P25294 352 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SCD5P34758 872 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MRPL16P38064 232 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RIB1P38066 345 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ERG7P38604 731 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SOL3P38858 249 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YEA6P39953 335 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YEL057CP39983 233 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GTS1P40956 396 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W EXG2P52911 562 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ROG1P53118 685 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RTT102P53330 157 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SKG3Q06315 1026 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W UPC2Q12151 913 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PRR2Q12310 699 aa4.74□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PUT1P09368 476 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DPM1P14020 267 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W LSM2P38203 95 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IPT1P38954 527 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YAL037WP39728 267 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YGR273CP53329 174 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLR460CP54007 376 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MAK3Q03503 176 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HRD3Q05787 833 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GAS5Q08193 484 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YNR034W-AQ3E841 98 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TIR1P10863 254 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SPT15P13393 240 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SLY41P22215 453 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SDH4P37298 181 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W FLR1P38124 548 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YER158CP40095 573 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IME4P41833 600 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AQR1P53943 586 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CYT2Q00873 224 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W UBC7Q02159 165 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CAB1Q04430 367 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SNO4Q04902 237 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AAD4Q07747 329 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CSI2Q08054 341 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W NRT1Q08485 598 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IRC13Q08630 104 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HSP32Q08992 237 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W BI3Q9ZZW7 517 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLR422WQ06409 1932 aa4.73□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLR462WO13556 202 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CWP1P28319 239 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SNC2P33328 115 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ADD66P36040 267 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YHL049CP38722 271 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.2 ms