RNA–Protein interactions for RNA: YMR163C

INP2, Transcript of Peroxisome-specific receptor important for peroxisome inheritance, yeast

Gene INP2, Length 2,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP2	YMR163C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YPR1	Q12458	312 aa		0.87	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RAD7	P06779	565 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SWC5	P38326	303 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	DAN1	P47178	298 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	OST3	P48439	350 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	IZH4	Q99393	312 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SUR2	P38992	349 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YLL007C	Q07799	665 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	APC9	Q12107	265 aa		0.86	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	AEP1	P32493	518 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	END3	P39013	349 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SEN34	P39707	275 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RPE1	P46969	238 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YOR114W	Q12219	294 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SWI3	P32591	825 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	COT1	P32798	439 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	NRG2	P38082	220 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YPL039W	Q03080	316 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	DPP1	Q05521	289 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	ATG15	P25641	520 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	POP8	P38208	133 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	PHO89	P38361	574 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SLM2	P53955	656 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YDR286C	Q05530	114 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YLR297W	Q05899	129 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YOL019W	Q08157	551 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YOR268C	Q08734	132 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.84	□□□□□ -2.27
INP2	YMR163C	SPT7	P35177	1332 aa		0.84	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	CAJ1	P39101	391 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	ABZ2	Q03266	374 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	VPS20	Q04272	221 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YPL150W	Q12152	901 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	RAD10	P06838	210 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	TFS1	P14306	219 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SCO1	P23833	295 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YKL063C	P35725	167 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	RPC37	P36121	282 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SSO2	P39926	295 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YML018C	Q03730	393 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SPO77	Q06134	477 aa		0.83	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	ERG2	P32352	222 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	KRE6	P32486	720 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	FCY21	P40039	528 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	COX16	P47081	118 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	COG7	P53195	279 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	CAB4	P53332	305 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YMR209C	Q03648	457 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	DCR2	Q05924	578 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	ASR1	Q06834	288 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	PGC1	Q08959	321 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	PET18	P25362	215 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SUA5	P32579	426 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	BLI1	P35727	113 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	POP2	P39008	433 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	MND1	P53102	219 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	COS6	P53344	381 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	LOA1	Q06508	300 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	SIA1	Q12212	622 aa		0.82	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.81	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
INP2	YMR163C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
INP2	YMR163C	ARN2	P38724	620 aa		0.81	□□□□□ -2.28

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