RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	MAL13	P53338	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	HPF1	Q05164	967 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RIB3	Q99258	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YKL097C	P34245	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	APL3	P38065	1025 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YBR096W	P38256	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RPP1	P38786	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	COS1	P53822	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SWP1	Q02795	286 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TDA6	Q06466	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ICT1	Q12385	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	AI3	P03877	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	NVJ1	P38881	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RRG9	P40156	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PAC10	P48363	199 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ORM1	P53224	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	GPI15	P53961	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HER2	Q03557	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HEM15	P16622	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TYR1	P20049	452 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MRPL28	P36527	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YBR137W	P38276	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SLM6	P38343	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CHA4	P43634	648 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SWC4	P53201	476 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	UBC7	Q02159	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CTR3	Q06686	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TAF10	Q12030	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TFC1	P32367	649 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MKK1	P32490	508 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ZRT1	P32804	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	POP4	P38336	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YHR035W	P38769	630 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	GLC8	P41818	229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YJR012C	P47087	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ILM1	P47155	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CPR8	P53728	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HEM25	Q07534	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ATP16	Q12165	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HEM2	P05373	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	EPT1	P22140	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TRM9	P49957	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MST27	P53176	234 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RIM8	P53179	542 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PDR17	P53844	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	DID2	P69771	204 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MCH4	Q08268	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SIR4	P11978	1358 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MET2	P08465	486 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CTP1	P38152	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FAA2	P39518	744 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PGD1	P40356	397 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CDH1	P53197	566 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	CAF40	P53829	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	ASI3	P53983	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	FAR10	Q06001	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	THI72	Q08579	599 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	GLN3	P18494	730 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YEF1	P32622	495 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	MAM33	P40513	266 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	AZF1	P41696	914 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	AIM23	P47015	356 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	SAE3	P89114	91 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	STP1	Q00947	519 aa		4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
STB2	YMR053C	YML053C	Q04978	212 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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